More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1552 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  58.49 
 
 		 536 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  93.53 
 
 		 542 aa  1054    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  64.46 
 
 		 553 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  70.9 
 
 		 552 aa  798    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  66 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  63.45 
 
 		 554 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  71.72 
 
 		 546 aa  777    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  69.91 
 
 		 542 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  69.63 
 
 		 545 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  92.07 
 
 		 543 aa  1042    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  56.91 
 
 		 533 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  69.63 
 
 		 546 aa  747    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  100 
 
 		 543 aa  1119    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  69.81 
 
 		 545 aa  764    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  69.63 
 
 		 545 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  62.41 
 
 		 552 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  66 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  68.82 
 
 		 545 aa  763    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  69.19 
 
 		 545 aa  767    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  99.45 
 
 		 543 aa  1114    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  68.59 
 
 		 544 aa  760    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  66.24 
 
 		 546 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  70.74 
 
 		 545 aa  770    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  68.89 
 
 		 545 aa  760    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  64.3 
 
 		 550 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  70.37 
 
 		 545 aa  774    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  67.34 
 
 		 546 aa  758    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  66.18 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  66 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  66.54 
 
 		 550 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  94.48 
 
 		 543 aa  1068    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.33 
 
 		 534 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  66 
 
 		 550 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  69.14 
 
 		 551 aa  776    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  66 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  59.38 
 
 		 538 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  58.72 
 
 		 548 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  69.61 
 
 		 543 aa  780    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  67.41 
 
 		 555 aa  753    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  68.95 
 
 		 545 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  59.4 
 
 		 540 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  65.92 
 
 		 566 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  93.35 
 
 		 542 aa  1053    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  69.81 
 
 		 545 aa  764    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  66.18 
 
 		 553 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  69.81 
 
 		 545 aa  764    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  66 
 
 		 570 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  93.53 
 
 		 542 aa  1054    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  60.58 
 
 		 554 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  66 
 
 		 553 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  62.71 
 
 		 555 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  74.12 
 
 		 543 aa  837    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  68.76 
 
 		 546 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  65.87 
 
 		 542 aa  739    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  61.86 
 
 		 563 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  65.45 
 
 		 557 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  69.63 
 
 		 545 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  68.21 
 
 		 545 aa  746    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  74.48 
 
 		 548 aa  820    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  67.04 
 
 		 555 aa  749    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  68.22 
 
 		 544 aa  759    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  63.45 
 
 		 549 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  66.17 
 
 		 543 aa  742    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  74.77 
 
 		 544 aa  805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  66.18 
 
 		 553 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  67.22 
 
 		 543 aa  752    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  66.18 
 
 		 552 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  72.19 
 
 		 543 aa  786    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.56 
 
 		 553 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  61.62 
 
 		 555 aa  688    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  94.82 
 
 		 542 aa  1064    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  71.3 
 
 		 542 aa  787    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  59.12 
 
 		 557 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  70 
 
 		 546 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  70.19 
 
 		 546 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  70.82 
 
 		 540 aa  790    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  68.02 
 
 		 545 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  69.63 
 
 		 545 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  68.52 
 
 		 545 aa  735    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  65.81 
 
 		 552 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  90.86 
 
 		 542 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  69.63 
 
 		 545 aa  749    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  66.18 
 
 		 552 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.99 
 
 		 557 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.96 
 
 		 547 aa  663    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  70 
 
 		 546 aa  752    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  90.86 
 
 		 542 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  69.44 
 
 		 545 aa  769    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  69.74 
 
 		 545 aa  759    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  69.94 
 
 		 545 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  79.26 
 
 		 542 aa  887    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.36 
 
 		 547 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  61.64 
 
 		 559 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  62.2 
 
 		 566 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  61.38 
 
 		 552 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>