More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3351 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  77.86 
 
 		 545 aa  857    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  77.86 
 
 		 545 aa  857    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.03 
 
 		 540 aa  670    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  69.07 
 
 		 542 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  77.86 
 
 		 545 aa  857    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  66.6 
 
 		 552 aa  747    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  59.15 
 
 		 542 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  63.62 
 
 		 554 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.58 
 
 		 533 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  77.45 
 
 		 542 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  68.82 
 
 		 543 aa  777    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  78.49 
 
 		 545 aa  877    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  62.85 
 
 		 543 aa  717    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  90.81 
 
 		 546 aa  1001    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  68.52 
 
 		 543 aa  764    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.78 
 
 		 553 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  77.86 
 
 		 545 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  63.09 
 
 		 553 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  63.64 
 
 		 553 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  65.87 
 
 		 545 aa  728    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  65.87 
 
 		 545 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  68.52 
 
 		 543 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  63.87 
 
 		 544 aa  723    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  64.7 
 
 		 546 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  63.45 
 
 		 553 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  90.26 
 
 		 545 aa  1000    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  64.35 
 
 		 550 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  61.18 
 
 		 557 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.17 
 
 		 546 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  68.51 
 
 		 544 aa  751    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  63.64 
 
 		 553 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  65.74 
 
 		 550 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  69.87 
 
 		 543 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.75 
 
 		 534 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  63.19 
 
 		 550 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  90.81 
 
 		 545 aa  1004    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  64.01 
 
 		 555 aa  737    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.37 
 
 		 548 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  63.45 
 
 		 543 aa  726    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  77.39 
 
 		 545 aa  859    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  63.69 
 
 		 559 aa  720    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  77.02 
 
 		 545 aa  856    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  64.06 
 
 		 566 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  77.86 
 
 		 545 aa  857    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  57.51 
 
 		 537 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  63.82 
 
 		 553 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59 
 
 		 555 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  63.75 
 
 		 553 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  69.07 
 
 		 542 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  95.05 
 
 		 545 aa  1048    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  61.96 
 
 		 554 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  62.16 
 
 		 552 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  61.28 
 
 		 555 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  66.67 
 
 		 543 aa  772    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  64.01 
 
 		 555 aa  736    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  65.8 
 
 		 542 aa  737    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  60.92 
 
 		 563 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  63.37 
 
 		 557 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  89.54 
 
 		 545 aa  990    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  69.07 
 
 		 542 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  69.49 
 
 		 548 aa  768    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  77.39 
 
 		 545 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  64.06 
 
 		 544 aa  726    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  63.99 
 
 		 549 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  71.32 
 
 		 543 aa  819    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  90.81 
 
 		 545 aa  1004    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  63.64 
 
 		 553 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  68.73 
 
 		 542 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  62.82 
 
 		 552 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  93.39 
 
 		 545 aa  1030    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  74.49 
 
 		 543 aa  842    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  59.78 
 
 		 545 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  63.64 
 
 		 570 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  90.81 
 
 		 545 aa  1004    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  94.49 
 
 		 546 aa  1041    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  76.57 
 
 		 542 aa  857    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  61.24 
 
 		 552 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  90.81 
 
 		 546 aa  1001    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  90.81 
 
 		 546 aa  1001    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  68.03 
 
 		 540 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  90.99 
 
 		 545 aa  1005    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.83 
 
 		 542 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  77.39 
 
 		 545 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  63.55 
 
 		 552 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  68.73 
 
 		 542 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  66.17 
 
 		 551 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  63.64 
 
 		 553 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  63.64 
 
 		 553 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  61.11 
 
 		 566 aa  692    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  62.82 
 
 		 552 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.56 
 
 		 557 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.48 
 
 		 547 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  90.81 
 
 		 546 aa  1001    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  80.22 
 
 		 546 aa  888    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  61.48 
 
 		 555 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  77.12 
 
 		 545 aa  852    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  89.71 
 
 		 545 aa  990    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  74.12 
 
 		 545 aa  855    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  69.2 
 
 		 542 aa  781    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.3 
 
 		 547 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>