More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3156 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  74.72 
 
 		 542 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  76.94 
 
 		 542 aa  869    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  58.26 
 
 		 536 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  58.52 
 
 		 542 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  59.29 
 
 		 547 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  76.2 
 
 		 557 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  75.46 
 
 		 542 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  75.46 
 
 		 542 aa  846    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  74.91 
 
 		 542 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.15 
 
 		 543 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  65.45 
 
 		 547 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  58.49 
 
 		 550 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  70.22 
 
 		 544 aa  789    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  59.63 
 
 		 549 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  76.57 
 
 		 542 aa  854    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  76.2 
 
 		 542 aa  854    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  57.72 
 
 		 546 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  76.98 
 
 		 543 aa  845    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  76.57 
 
 		 542 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  58.64 
 
 		 550 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  58.3 
 
 		 543 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  65.45 
 
 		 547 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  58.66 
 
 		 534 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  60.45 
 
 		 546 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  70.06 
 
 		 542 aa  793    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59.29 
 
 		 553 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  58.63 
 
 		 538 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.93 
 
 		 548 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  59.04 
 
 		 543 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  72.69 
 
 		 542 aa  798    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  60.15 
 
 		 545 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  75.32 
 
 		 543 aa  838    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  70.22 
 
 		 543 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  61.9 
 
 		 551 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  67.82 
 
 		 547 aa  756    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  66 
 
 		 547 aa  740    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  76.61 
 
 		 543 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  74.54 
 
 		 555 aa  838    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  59.07 
 
 		 547 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  75.87 
 
 		 543 aa  839    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  76.94 
 
 		 542 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  75.69 
 
 		 545 aa  834    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  56.64 
 
 		 534 aa  636    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  75.83 
 
 		 542 aa  849    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  58.33 
 
 		 558 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  67.46 
 
 		 547 aa  754    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  69.43 
 
 		 543 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  72.19 
 
 		 543 aa  794    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  65.63 
 
 		 547 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  58.78 
 
 		 546 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  76.38 
 
 		 545 aa  875    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  75.83 
 
 		 542 aa  841    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  76.2 
 
 		 542 aa  855    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  100 
 
 		 542 aa  1113    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  76.2 
 
 		 542 aa  848    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  74.35 
 
 		 542 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  59.51 
 
 		 546 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.52 
 
 		 540 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  59.33 
 
 		 545 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  71.59 
 
 		 542 aa  813    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  58.52 
 
 		 542 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  60.11 
 
 		 555 aa  661    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  58.12 
 
 		 542 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  77.35 
 
 		 543 aa  853    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  62.85 
 
 		 547 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  58.52 
 
 		 542 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  73.45 
 
 		 550 aa  816    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  63.5 
 
 		 547 aa  693    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  75.87 
 
 		 543 aa  840    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  71.45 
 
 		 543 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  56.16 
 
 		 529 aa  634  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.83 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  59.14 
 
 		 545 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  59.14 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  58.33 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  59.14 
 
 		 546 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  59.15 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  59.14 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.41 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  59.14 
 
 		 546 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  58.04 
 
 		 545 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  57.06 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  58.77 
 
 		 545 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  58.04 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  59.66 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  58.44 
 
 		 566 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  58.96 
 
 		 545 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  57.64 
 
 		 545 aa  631  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  58.77 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  56.19 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  57.67 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  58.07 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.93 
 
 		 543 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>