More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3181 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  67.52 
 
 
543 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  59.52 
 
 
551 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  56.77 
 
 
529 aa  636    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  67.82 
 
 
542 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  67.64 
 
 
542 aa  764    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  67.64 
 
 
555 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  68.19 
 
 
542 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  67.82 
 
 
542 aa  756    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  84.64 
 
 
547 aa  942    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  66.73 
 
 
542 aa  744    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  88.12 
 
 
547 aa  983    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  68.43 
 
 
543 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  68.37 
 
 
542 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  84.64 
 
 
547 aa  943    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  63.69 
 
 
543 aa  705    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  83.55 
 
 
547 aa  936    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.09 
 
 
547 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  68.01 
 
 
542 aa  767    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  68.01 
 
 
542 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  58.56 
 
 
538 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.14 
 
 
548 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  68.37 
 
 
542 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  68.11 
 
 
550 aa  756    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  67.88 
 
 
542 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  65.08 
 
 
542 aa  713    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  67.82 
 
 
542 aa  750    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  68.07 
 
 
543 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  65.21 
 
 
543 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  100 
 
 
547 aa  1121    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  68.25 
 
 
543 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  68.74 
 
 
542 aa  754    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  68.07 
 
 
543 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  67.88 
 
 
543 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  67.52 
 
 
545 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  56.33 
 
 
546 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  89.58 
 
 
547 aa  987    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  64.96 
 
 
543 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  67.82 
 
 
542 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  67.64 
 
 
545 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.78 
 
 
550 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  66.73 
 
 
557 aa  743    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  63.69 
 
 
543 aa  691    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  58.78 
 
 
540 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  69.84 
 
 
542 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  66.36 
 
 
542 aa  763    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  65.21 
 
 
544 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.2 
 
 
553 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  64.1 
 
 
542 aa  734    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  67.64 
 
 
542 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  80.29 
 
 
547 aa  892    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  57.09 
 
 
547 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.85 
 
 
536 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  58.9 
 
 
547 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  58.53 
 
 
534 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.41 
 
 
557 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  57.54 
 
 
555 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.73 
 
 
534 aa  621  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.14 
 
 
542 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.12 
 
 
542 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.12 
 
 
542 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.93 
 
 
542 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  56.59 
 
 
543 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  55.96 
 
 
532 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  54.78 
 
 
554 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  55.21 
 
 
546 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  55.27 
 
 
550 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.56 
 
 
543 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  54.95 
 
 
558 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  56.54 
 
 
533 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  56.93 
 
 
543 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  56.19 
 
 
533 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0171  CTP synthetase  52.68 
 
 
532 aa  605  9.999999999999999e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  56.19 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.41 
 
 
542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  55.76 
 
 
544 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0114  CTP synthetase  52.13 
 
 
538 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.462919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  55.72 
 
 
547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  55.01 
 
 
543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.33 
 
 
543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.17 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  56.69 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  55.21 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.41 
 
 
542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  56.67 
 
 
535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  52.5 
 
 
534 aa  600  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  56.33 
 
 
545 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  56.54 
 
 
546 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  56.33 
 
 
546 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  56.64 
 
 
545 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.76 
 
 
533 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  53.66 
 
 
533 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  56.15 
 
 
545 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  56.51 
 
 
546 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  53.85 
 
 
533 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  53.94 
 
 
545 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  53.71 
 
 
552 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.78 
 
 
534 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  55.96 
 
 
545 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  56.33 
 
 
546 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>