More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1238 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  70.17 
 
 
555 aa  774    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  72.19 
 
 
542 aa  788    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.07 
 
 
536 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  61 
 
 
542 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  64.78 
 
 
547 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  62.15 
 
 
552 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  63.54 
 
 
555 aa  666    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  72.93 
 
 
542 aa  779    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  64.23 
 
 
547 aa  701    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  70.35 
 
 
542 aa  773    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  78.68 
 
 
543 aa  859    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  72.74 
 
 
542 aa  789    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  72.19 
 
 
542 aa  794    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  62.36 
 
 
547 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  73.48 
 
 
542 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  60.63 
 
 
543 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  70.72 
 
 
542 aa  775    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  60.37 
 
 
546 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  71.82 
 
 
543 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  71.27 
 
 
542 aa  786    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  60.63 
 
 
543 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  64.78 
 
 
547 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  59.55 
 
 
534 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  70.64 
 
 
544 aa  778    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  61.4 
 
 
542 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  67.34 
 
 
542 aa  740    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  72.74 
 
 
542 aa  794    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  59.81 
 
 
538 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  58.56 
 
 
548 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  60.66 
 
 
543 aa  651    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  71.82 
 
 
543 aa  783    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  74.95 
 
 
542 aa  812    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  60.63 
 
 
542 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  70.72 
 
 
543 aa  784    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  70.64 
 
 
543 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  63.69 
 
 
547 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  71.64 
 
 
543 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  72.19 
 
 
557 aa  785    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  71.27 
 
 
542 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  71.64 
 
 
543 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  72.01 
 
 
545 aa  779    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  71.45 
 
 
543 aa  793    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  72.01 
 
 
542 aa  790    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  72.19 
 
 
542 aa  787    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  64.78 
 
 
547 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  70.77 
 
 
543 aa  771    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  61 
 
 
542 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  72.19 
 
 
545 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  59.78 
 
 
546 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  60.63 
 
 
543 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  71.27 
 
 
542 aa  784    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  61 
 
 
543 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  63.89 
 
 
540 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  100 
 
 
543 aa  1098    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  69.8 
 
 
542 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  60.74 
 
 
542 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  70.11 
 
 
550 aa  755    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  63.77 
 
 
551 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  64.42 
 
 
547 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  61 
 
 
542 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  70.9 
 
 
542 aa  779    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  62.55 
 
 
547 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  60.74 
 
 
542 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  66.06 
 
 
547 aa  711    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  72.74 
 
 
542 aa  793    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  59.78 
 
 
546 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  55.87 
 
 
529 aa  633  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  60.63 
 
 
543 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  59.52 
 
 
543 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  59.29 
 
 
550 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  60.97 
 
 
545 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  60.37 
 
 
555 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  59.23 
 
 
546 aa  631  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  59.59 
 
 
545 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  60.59 
 
 
545 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.33 
 
 
553 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  60.04 
 
 
545 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.37 
 
 
555 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  60.22 
 
 
545 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  58.35 
 
 
542 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.51 
 
 
550 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  60.19 
 
 
555 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  58.35 
 
 
546 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  60.04 
 
 
545 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  60.19 
 
 
548 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  60.04 
 
 
545 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  59.67 
 
 
542 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  60.34 
 
 
545 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  60.04 
 
 
545 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  60.04 
 
 
545 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  59.59 
 
 
533 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  59.27 
 
 
550 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  60.52 
 
 
549 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  59.78 
 
 
545 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  59.59 
 
 
533 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  60.15 
 
 
545 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  60.34 
 
 
546 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0114  CTP synthetase  55.47 
 
 
538 aa  619  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.462919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  59.67 
 
 
545 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  59.78 
 
 
545 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>