More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002506 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  895    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  79.85 
 
 		 545 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.06 
 
 		 536 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  72.1 
 
 		 542 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  64.88 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  66.67 
 
 		 543 aa  757    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  66.48 
 
 		 552 aa  749    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  70.34 
 
 		 544 aa  761    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  65.06 
 
 		 554 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  97.07 
 
 		 546 aa  1070    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  79.48 
 
 		 542 aa  877    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  60.19 
 
 		 566 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  72.47 
 
 		 543 aa  813    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  61.62 
 
 		 552 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  79.3 
 
 		 546 aa  889    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  71.72 
 
 		 543 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  66.79 
 
 		 555 aa  752    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  60.48 
 
 		 542 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  58.78 
 
 		 542 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  64.88 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  67.23 
 
 		 545 aa  736    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  67.23 
 
 		 545 aa  739    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  71.72 
 
 		 543 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  65.92 
 
 		 544 aa  751    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  66.97 
 
 		 546 aa  760    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  64.88 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  81.04 
 
 		 545 aa  906    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  63.93 
 
 		 550 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  65.17 
 
 		 551 aa  746    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  64.55 
 
 		 546 aa  730    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  81.19 
 
 		 545 aa  903    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  59.7 
 
 		 543 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  64.88 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  63.64 
 
 		 550 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  73.03 
 
 		 543 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  64.7 
 
 		 553 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.61 
 
 		 534 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  65.21 
 
 		 550 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  62.92 
 
 		 559 aa  711    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  64.51 
 
 		 553 aa  711    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.25 
 
 		 538 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.48 
 
 		 548 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  66.6 
 
 		 543 aa  762    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  895    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  95.41 
 
 		 545 aa  1055    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  65.74 
 
 		 566 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  58.96 
 
 		 542 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.8 
 
 		 537 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  64.3 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59.44 
 
 		 555 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  59.85 
 
 		 554 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  81.16 
 
 		 545 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  64.88 
 
 		 553 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  81.34 
 
 		 545 aa  896    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  61.74 
 
 		 555 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  67.53 
 
 		 543 aa  789    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  58.96 
 
 		 543 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  64.02 
 
 		 542 aa  729    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  59.93 
 
 		 563 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  65.25 
 
 		 557 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  79.66 
 
 		 545 aa  875    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  70.11 
 
 		 548 aa  776    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  58.26 
 
 		 545 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  66.29 
 
 		 544 aa  753    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  64.33 
 
 		 549 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  73.99 
 
 		 543 aa  861    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  71.54 
 
 		 542 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  81.23 
 
 		 545 aa  904    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  889    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  64.85 
 
 		 552 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  61 
 
 		 557 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  78.73 
 
 		 543 aa  870    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  59.44 
 
 		 545 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  60.63 
 
 		 555 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.93 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.93 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  80.96 
 
 		 542 aa  914    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.33 
 
 		 547 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  80.04 
 
 		 546 aa  893    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  80.04 
 
 		 546 aa  896    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  66.67 
 
 		 540 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  882    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  79.27 
 
 		 546 aa  885    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  72.1 
 
 		 542 aa  804    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  65.21 
 
 		 552 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  71.54 
 
 		 542 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  72.22 
 
 		 542 aa  813    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  64.88 
 
 		 570 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  75.6 
 
 		 545 aa  879    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  64.85 
 
 		 552 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.59 
 
 		 557 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.98 
 
 		 547 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  79.85 
 
 		 546 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  61.06 
 
 		 552 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.22 
 
 		 533 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  79.85 
 
 		 545 aa  895    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  81.53 
 
 		 545 aa  895    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>