More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3111 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  95.23 
 
 
545 aa  1052    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  95.23 
 
 
545 aa  1052    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.51 
 
 
536 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  70.74 
 
 
542 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  63.57 
 
 
570 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  64.3 
 
 
553 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  67.23 
 
 
552 aa  765    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  69.63 
 
 
542 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  62.91 
 
 
554 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  95.23 
 
 
545 aa  1052    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  74.86 
 
 
542 aa  832    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  63.57 
 
 
553 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  63.54 
 
 
551 aa  738    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  70.74 
 
 
542 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  78.9 
 
 
546 aa  867    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  70 
 
 
543 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.21 
 
 
553 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  78.35 
 
 
545 aa  866    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  78.23 
 
 
545 aa  861    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  63.57 
 
 
553 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  63.17 
 
 
545 aa  712    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  63.35 
 
 
545 aa  714    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  70 
 
 
543 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  64.02 
 
 
544 aa  731    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  65.32 
 
 
546 aa  755    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  63.57 
 
 
553 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  81.15 
 
 
546 aa  900    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  62.59 
 
 
550 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  78.23 
 
 
545 aa  863    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.97 
 
 
546 aa  737    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.44 
 
 
540 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  77.49 
 
 
546 aa  858    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  63.57 
 
 
553 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  65 
 
 
550 aa  726    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  71.16 
 
 
543 aa  809    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.93 
 
 
534 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  64.88 
 
 
550 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  78.35 
 
 
545 aa  866    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  63.82 
 
 
553 aa  718    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  56.86 
 
 
538 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.75 
 
 
548 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  65.12 
 
 
543 aa  759    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  62.25 
 
 
552 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  60.93 
 
 
555 aa  693    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  70.98 
 
 
543 aa  814    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  63.69 
 
 
566 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  57.62 
 
 
537 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  63.39 
 
 
553 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  58.46 
 
 
555 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.59 
 
 
542 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  65.54 
 
 
555 aa  763    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  78.35 
 
 
545 aa  866    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  61.83 
 
 
555 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  67.41 
 
 
543 aa  783    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  90.83 
 
 
545 aa  1025    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  63.77 
 
 
542 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  61.28 
 
 
563 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  63.92 
 
 
557 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  78.04 
 
 
545 aa  863    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  62.48 
 
 
543 aa  723    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  69.11 
 
 
548 aa  768    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  70.74 
 
 
542 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  64.21 
 
 
544 aa  734    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  63.21 
 
 
549 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  82.69 
 
 
543 aa  941    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  92.66 
 
 
545 aa  1038    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  63.57 
 
 
553 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  65.73 
 
 
555 aa  762    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  64.51 
 
 
552 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  74.77 
 
 
543 aa  842    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  95.23 
 
 
545 aa  1052    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  62.61 
 
 
552 aa  723    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  90.83 
 
 
545 aa  1025    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.2 
 
 
555 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  81.18 
 
 
542 aa  914    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  78.17 
 
 
545 aa  865    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  78.9 
 
 
546 aa  867    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  78.72 
 
 
546 aa  868    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  65.8 
 
 
540 aa  760    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  77.49 
 
 
545 aa  860    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  58.49 
 
 
542 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  67.22 
 
 
544 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  63.7 
 
 
552 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  69.63 
 
 
542 aa  808    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  80.55 
 
 
545 aa  909    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  90.83 
 
 
545 aa  1025    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  64.51 
 
 
552 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.46 
 
 
557 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.33 
 
 
547 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  78.9 
 
 
546 aa  867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  61.64 
 
 
554 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  63.39 
 
 
553 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  59.89 
 
 
557 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  95.96 
 
 
545 aa  1065    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  79.34 
 
 
545 aa  876    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  74.68 
 
 
545 aa  852    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  69.94 
 
 
542 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.86 
 
 
547 aa  651    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  63.39 
 
 
559 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  60.51 
 
 
566 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>