More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2765 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  72.18 
 
 		 542 aa  806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  58.14 
 
 		 536 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  59.45 
 
 		 551 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  56.75 
 
 		 529 aa  642    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  72.36 
 
 		 542 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  73.82 
 
 		 542 aa  821    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  71.82 
 
 		 555 aa  798    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  66.13 
 
 		 547 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  68.55 
 
 		 544 aa  761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  58.39 
 
 		 542 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  72.73 
 
 		 542 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  66.13 
 
 		 547 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  71.27 
 
 		 542 aa  790    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  72.96 
 
 		 543 aa  798    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  73.32 
 
 		 543 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  66.13 
 
 		 547 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  73.45 
 
 		 542 aa  807    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.79 
 
 		 547 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.48 
 
 		 548 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.76 
 
 		 543 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  70.11 
 
 		 543 aa  755    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  73.27 
 
 		 542 aa  812    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  68.18 
 
 		 542 aa  737    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  74.18 
 
 		 542 aa  824    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  60.04 
 
 		 550 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  71.87 
 
 		 543 aa  788    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  69.64 
 
 		 543 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  68.11 
 
 		 547 aa  756    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  73.32 
 
 		 543 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  100 
 
 		 550 aa  1134    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  72.05 
 
 		 543 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  73.09 
 
 		 542 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  74.05 
 
 		 545 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  73.45 
 
 		 542 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  74.36 
 
 		 542 aa  818    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  68.11 
 
 		 547 aa  755    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  67.64 
 
 		 543 aa  758    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  70.73 
 
 		 542 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  73.32 
 
 		 543 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  72.55 
 
 		 545 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  73.09 
 
 		 542 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  72.55 
 
 		 542 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.21 
 
 		 543 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  58.35 
 
 		 540 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  72.36 
 
 		 542 aa  821    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  60 
 
 		 542 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  68.18 
 
 		 543 aa  766    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.41 
 
 		 547 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  70.73 
 
 		 542 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  65.83 
 
 		 547 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  65.95 
 
 		 547 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  70.73 
 
 		 557 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  68.31 
 
 		 542 aa  766    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  58.21 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.64 
 
 		 534 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  58.21 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.59 
 
 		 538 aa  631  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.17 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  58.21 
 
 		 543 aa  631  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  57.69 
 
 		 555 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  58.03 
 
 		 542 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  58.03 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.95 
 
 		 558 aa  631  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  56.93 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  58.21 
 
 		 543 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  58.21 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.3 
 
 		 546 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  56.86 
 
 		 546 aa  621  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  57.66 
 
 		 546 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  57.3 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  54.51 
 
 		 534 aa  619  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  56.12 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  57.04 
 
 		 542 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  56.36 
 
 		 563 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  55.76 
 
 		 544 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  58.32 
 
 		 543 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  56.34 
 
 		 550 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  55.86 
 
 		 543 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  56 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  58.35 
 
 		 533 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  56.31 
 
 		 559 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  58.17 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  56.57 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.83 
 
 		 543 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  57.12 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  56.7 
 
 		 542 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  56.7 
 
 		 542 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.23 
 
 		 552 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.06 
 
 		 546 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  58.82 
 
 		 534 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  55.98 
 
 		 552 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  56.12 
 
 		 559 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  56.52 
 
 		 545 aa  611  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  55.9 
 
 		 547 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  54.99 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.2 
 
 		 540 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  55.84 
 
 		 535 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  55.76 
 
 		 555 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  56.65 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  54.89 
 
 		 552 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>