More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1563 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.25 
 
 		 535 aa  666    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  59.54 
 
 		 533 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.29 
 
 		 536 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.35 
 
 		 535 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.6 
 
 		 531 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.49 
 
 		 535 aa  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.14 
 
 		 546 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.97 
 
 		 535 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  56.65 
 
 		 530 aa  643    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  54.97 
 
 		 535 aa  648    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  54.49 
 
 		 535 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.16 
 
 		 535 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.16 
 
 		 535 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.69 
 
 		 541 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  55.91 
 
 		 555 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.16 
 
 		 535 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  64.38 
 
 		 533 aa  709    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  54.41 
 
 		 555 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  56.43 
 
 		 546 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  56.77 
 
 		 550 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  60.54 
 
 		 534 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.44 
 
 		 533 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.11 
 
 		 538 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  54.49 
 
 		 535 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.35 
 
 		 535 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.27 
 
 		 537 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  56.36 
 
 		 559 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  57.66 
 
 		 555 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.7 
 
 		 542 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.91 
 
 		 535 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.1 
 
 		 555 aa  658    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  57.84 
 
 		 555 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  59.06 
 
 		 534 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.12 
 
 		 531 aa  675    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  100 
 
 		 534 aa  1091    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.87 
 
 		 536 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  55.79 
 
 		 545 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.16 
 
 		 535 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.83 
 
 		 553 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.43 
 
 		 558 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  55.7 
 
 		 536 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  57.84 
 
 		 555 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  60.8 
 
 		 533 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  60.8 
 
 		 533 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  53.98 
 
 		 535 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  53.98 
 
 		 535 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.74 
 
 		 540 aa  655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  55.7 
 
 		 538 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  59.12 
 
 		 546 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.54 
 
 		 550 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.16 
 
 		 535 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.51 
 
 		 534 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  55.7 
 
 		 536 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  59.4 
 
 		 557 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.35 
 
 		 547 aa  658    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  58.8 
 
 		 535 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  55.81 
 
 		 552 aa  631  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.77 
 
 		 537 aa  633  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  56.55 
 
 		 547 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  54.93 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  55.19 
 
 		 543 aa  633  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  56.98 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  55.82 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  55.35 
 
 		 542 aa  631  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  54.93 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  54.46 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  54.7 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  54.46 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  54.43 
 
 		 543 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  55.2 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.24 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  54.46 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  55.97 
 
 		 539 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  54.34 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.63 
 
 		 542 aa  630  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  52.84 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  54.9 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  54.58 
 
 		 554 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  56.12 
 
 		 554 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  55.7 
 
 		 549 aa  625  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  53.79 
 
 		 543 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  54.09 
 
 		 542 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  55.56 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.08 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  54.71 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  55.66 
 
 		 563 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  56.64 
 
 		 550 aa  623  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  54.27 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  53.13 
 
 		 547 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  54.82 
 
 		 534 aa  624  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  52.94 
 
 		 547 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  53.35 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  54.56 
 
 		 565 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  52.08 
 
 		 534 aa  622  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  55.08 
 
 		 547 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  56.8 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  55.8 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  53.51 
 
 		 546 aa  618  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  55.93 
 
 		 545 aa  618  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  54.43 
 
 		 545 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>