More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2180 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  59.34 
 
 		 545 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  59.34 
 
 		 545 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  61.71 
 
 		 544 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  62.17 
 
 		 536 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  59.78 
 
 		 542 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  61.5 
 
 		 536 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  56.55 
 
 		 536 aa  648    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  62.5 
 
 		 535 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  57.95 
 
 		 552 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.15 
 
 		 551 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.82 
 
 		 543 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  64.79 
 
 		 535 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  59.16 
 
 		 545 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  61.9 
 
 		 544 aa  671    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  58.35 
 
 		 534 aa  674    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  59.71 
 
 		 545 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  60.29 
 
 		 546 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  59.4 
 
 		 543 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  64.61 
 
 		 535 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  64.42 
 
 		 535 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  64.61 
 
 		 535 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  60 
 
 		 555 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  63.31 
 
 		 555 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  59.34 
 
 		 545 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  59.4 
 
 		 543 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  58.7 
 
 		 544 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  61.73 
 
 		 534 aa  698    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  62.38 
 
 		 581 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  60.19 
 
 		 555 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  56.29 
 
 		 537 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  58.63 
 
 		 542 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  64.14 
 
 		 545 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  59.06 
 
 		 536 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  60.22 
 
 		 550 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.96 
 
 		 543 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  61.25 
 
 		 534 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  59.78 
 
 		 555 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  61.68 
 
 		 549 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  63.31 
 
 		 557 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  60.93 
 
 		 549 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  62.71 
 
 		 538 aa  690    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.48 
 
 		 548 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  64.71 
 
 		 545 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  64.61 
 
 		 535 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  59.66 
 
 		 536 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  62.62 
 
 		 546 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  61.31 
 
 		 534 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  70.49 
 
 		 533 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  69.74 
 
 		 537 aa  758    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  60.82 
 
 		 558 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.37 
 
 		 555 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  59.07 
 
 		 608 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  64.88 
 
 		 542 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  59.34 
 
 		 545 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  59.81 
 
 		 536 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  60.48 
 
 		 545 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  60.85 
 
 		 545 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  61.5 
 
 		 536 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  58.99 
 
 		 548 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  58.23 
 
 		 544 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  61.4 
 
 		 545 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  57.2 
 
 		 543 aa  649    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.79 
 
 		 558 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  64.98 
 
 		 535 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  59.62 
 
 		 536 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  60.85 
 
 		 545 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  63.02 
 
 		 534 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  61.25 
 
 		 551 aa  663    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  59.38 
 
 		 543 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  57.78 
 
 		 542 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  56.98 
 
 		 539 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  63.65 
 
 		 535 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  63.65 
 
 		 535 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  59.19 
 
 		 542 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  60.26 
 
 		 571 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  60.48 
 
 		 546 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  60.48 
 
 		 546 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.08 
 
 		 540 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  60.58 
 
 		 545 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  62.45 
 
 		 542 aa  694    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  60.66 
 
 		 545 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  58.63 
 
 		 542 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  56.64 
 
 		 535 aa  645    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  57.09 
 
 		 544 aa  635    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  57.8 
 
 		 555 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  58.44 
 
 		 537 aa  674    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  59.29 
 
 		 534 aa  674    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  59.16 
 
 		 545 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  59.52 
 
 		 547 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  58.83 
 
 		 557 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.16 
 
 		 547 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  60.29 
 
 		 546 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  61.4 
 
 		 545 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60.94 
 
 		 535 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  61.09 
 
 		 533 aa  670    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  57.72 
 
 		 569 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  60.66 
 
 		 545 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  59.78 
 
 		 542 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  57.88 
 
 		 545 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  61.47 
 
 		 533 aa  676    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>