More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0174 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.93 
 
 
535 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.38 
 
 
541 aa  680    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  61.48 
 
 
532 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  57.83 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  79.37 
 
 
533 aa  881    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  58.38 
 
 
535 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  58.2 
 
 
535 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.96 
 
 
534 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  79.37 
 
 
533 aa  891    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  663    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  56.53 
 
 
555 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  61.22 
 
 
536 aa  683    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  59.55 
 
 
531 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  58.47 
 
 
547 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.22 
 
 
545 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.38 
 
 
536 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.27 
 
 
542 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  58.18 
 
 
547 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  58.38 
 
 
535 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.3 
 
 
546 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.23 
 
 
535 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.74 
 
 
537 aa  680    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  58.36 
 
 
547 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  57.78 
 
 
540 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.73 
 
 
538 aa  661    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.56 
 
 
534 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  57.25 
 
 
558 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  55.8 
 
 
558 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.29 
 
 
531 aa  669    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.96 
 
 
533 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  58.01 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.9 
 
 
551 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  58.2 
 
 
535 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.59 
 
 
535 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.59 
 
 
535 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  78.44 
 
 
533 aa  874    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  60.19 
 
 
533 aa  683    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  60.37 
 
 
542 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  57.27 
 
 
533 aa  643    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  55.1 
 
 
555 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  56.34 
 
 
555 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.38 
 
 
536 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  100 
 
 
542 aa  1106    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  77.32 
 
 
534 aa  877    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  59.52 
 
 
537 aa  651    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  56.4 
 
 
536 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  56.9 
 
 
536 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  56.4 
 
 
536 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  56.16 
 
 
549 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  56.42 
 
 
545 aa  631  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.75 
 
 
559 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  57.86 
 
 
531 aa  631  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.55 
 
 
549 aa  631  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.87 
 
 
557 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  55.27 
 
 
534 aa  628  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  56.03 
 
 
536 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.95 
 
 
533 aa  628  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  54.92 
 
 
534 aa  625  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  54.48 
 
 
558 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  55.45 
 
 
571 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.8 
 
 
536 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  54.9 
 
 
581 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  53.33 
 
 
608 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  55.25 
 
 
536 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  54.9 
 
 
534 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.12 
 
 
555 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  54.14 
 
 
572 aa  618  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  56.27 
 
 
534 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  53.99 
 
 
549 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  54.43 
 
 
546 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  53.99 
 
 
534 aa  615  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  55.08 
 
 
547 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  55.45 
 
 
558 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  53.44 
 
 
587 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  54.06 
 
 
538 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  53.45 
 
 
546 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  53.89 
 
 
532 aa  613  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.77 
 
 
534 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  55.04 
 
 
539 aa  609  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  52.83 
 
 
554 aa  609  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  52.67 
 
 
558 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  52.93 
 
 
567 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  53.22 
 
 
554 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  55.56 
 
 
553 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  53.64 
 
 
547 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  53.33 
 
 
533 aa  605  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  54.44 
 
 
559 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  53.08 
 
 
548 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  53.2 
 
 
554 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.64 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  53.48 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  53.3 
 
 
583 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  52.71 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  54.17 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  54.07 
 
 
535 aa  608  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  53.1 
 
 
569 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>