More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0791 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  59.14 
 
 
534 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  100 
 
 
534 aa  1088    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  55.37 
 
 
533 aa  629  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  57.63 
 
 
550 aa  629  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.82 
 
 
533 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  57.01 
 
 
533 aa  626  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  60.41 
 
 
546 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  57.36 
 
 
551 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.64 
 
 
533 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  55.7 
 
 
534 aa  623  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  56.61 
 
 
552 aa  618  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.9 
 
 
542 aa  620  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  57.63 
 
 
568 aa  618  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  55.83 
 
 
541 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.23 
 
 
533 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  57.44 
 
 
562 aa  611  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  56.17 
 
 
533 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  55.85 
 
 
535 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  59.85 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  54.51 
 
 
535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.36 
 
 
531 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  55.56 
 
 
534 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  53.78 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.6 
 
 
531 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.46 
 
 
559 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.94 
 
 
537 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  56.42 
 
 
529 aa  600  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  55.16 
 
 
535 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  54.61 
 
 
542 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.17 
 
 
547 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.92 
 
 
542 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  52.91 
 
 
536 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  52.91 
 
 
536 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  594  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  53.85 
 
 
540 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  52.63 
 
 
535 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  58.38 
 
 
526 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  53.22 
 
 
555 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  52.44 
 
 
535 aa  591  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  54.24 
 
 
536 aa  588  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  51.89 
 
 
534 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  52.26 
 
 
535 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  51.95 
 
 
542 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  53.38 
 
 
536 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  51.95 
 
 
542 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  52.24 
 
 
543 aa  588  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  52.32 
 
 
542 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  56.98 
 
 
525 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  52.13 
 
 
542 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  52.32 
 
 
542 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  51.95 
 
 
542 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  53.96 
 
 
542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  54.08 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  52.73 
 
 
533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.51 
 
 
545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  52.18 
 
 
546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  53.88 
 
 
531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  51.57 
 
 
608 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  52.37 
 
 
533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  53.13 
 
 
532 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  53.46 
 
 
536 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  50.66 
 
 
547 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  51.85 
 
 
543 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  50.85 
 
 
547 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  51.85 
 
 
543 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  52.05 
 
 
565 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.01 
 
 
537 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  55.87 
 
 
527 aa  580  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  53.08 
 
 
547 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  54.36 
 
 
530 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  53.22 
 
 
555 aa  579  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  52.17 
 
 
538 aa  578  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  51.76 
 
 
543 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  51.98 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  52.87 
 
 
543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  53.02 
 
 
534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  51.39 
 
 
543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  51.32 
 
 
537 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  53.98 
 
 
530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  52.68 
 
 
553 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  55.3 
 
 
531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  51.89 
 
 
547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  53.3 
 
 
538 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.26 
 
 
534 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53 
 
 
558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  52.37 
 
 
545 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  51.95 
 
 
540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  54.65 
 
 
558 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  52.17 
 
 
555 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  51.99 
 
 
557 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.72 
 
 
558 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>