More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2712 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  62.52 
 
 		 539 aa  706    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  59.55 
 
 		 539 aa  655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.3 
 
 		 531 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.89 
 
 		 542 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  63.07 
 
 		 565 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  60.63 
 
 		 547 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  58.93 
 
 		 538 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  60.97 
 
 		 597 aa  675    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  58.17 
 
 		 569 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  63.45 
 
 		 538 aa  720    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  59.56 
 
 		 565 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.56 
 
 		 537 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  57.49 
 
 		 531 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  64.19 
 
 		 550 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  61.12 
 
 		 535 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  58.44 
 
 		 536 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.04 
 
 		 541 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  60 
 
 		 569 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  60.34 
 
 		 565 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  64.75 
 
 		 539 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  64.73 
 
 		 537 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  58.72 
 
 		 564 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  61.38 
 
 		 554 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.13 
 
 		 532 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  59.96 
 
 		 534 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  100 
 
 		 563 aa  1156    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  59.55 
 
 		 540 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  60.55 
 
 		 565 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  62.15 
 
 		 539 aa  698    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  58.16 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.82 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.82 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.32 
 
 		 542 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  56.32 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  55.6 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  57.87 
 
 		 533 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  58.46 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  57.88 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  55.66 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.73 
 
 		 536 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.01 
 
 		 548 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  55.66 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.73 
 
 		 536 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.61 
 
 		 536 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  57.14 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.82 
 
 		 535 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.25 
 
 		 547 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  54.36 
 
 		 534 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.93 
 
 		 534 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.47 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.47 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  55.51 
 
 		 538 aa  611  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  56.59 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  56.19 
 
 		 558 aa  608  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  56.41 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  56.81 
 
 		 566 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  56.93 
 
 		 530 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.69 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  57.92 
 
 		 555 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.86 
 
 		 542 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  55.99 
 
 		 547 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.86 
 
 		 542 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  55.95 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.64 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  56.35 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  55.74 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.35 
 
 		 542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  55.82 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.73 
 
 		 534 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.84 
 
 		 546 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  56.28 
 
 		 543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.17 
 
 		 542 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  56.35 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  56.81 
 
 		 542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  56.91 
 
 		 543 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  54.58 
 
 		 535 aa  598  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  56.72 
 
 		 543 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  53.43 
 
 		 533 aa  600  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  54.37 
 
 		 608 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  55.86 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  56.74 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  54.39 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  54.58 
 
 		 547 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  55.15 
 
 		 543 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.29 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  53.93 
 
 		 554 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.47 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  54.92 
 
 		 533 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  56.55 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  56.07 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  56.23 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>