More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6612 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.47 
 
 		 533 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  62.06 
 
 		 539 aa  701    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  58.8 
 
 		 569 aa  659    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  100 
 
 		 550 aa  1142    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  68.97 
 
 		 554 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  57.38 
 
 		 597 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  57.3 
 
 		 569 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  57.12 
 
 		 541 aa  636    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  69.07 
 
 		 537 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  68.5 
 
 		 539 aa  764    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  69.29 
 
 		 539 aa  792    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  58.61 
 
 		 565 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  69.83 
 
 		 538 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  57.87 
 
 		 540 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  64.19 
 
 		 563 aa  716    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  66.73 
 
 		 539 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  68.28 
 
 		 565 aa  760    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  58.35 
 
 		 565 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  56.61 
 
 		 535 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  56.53 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.01 
 
 		 542 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  56.34 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  56.16 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.97 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.53 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  56.16 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  56.16 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.44 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  53.1 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  56.9 
 
 		 536 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  55.78 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  57.44 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.09 
 
 		 548 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.58 
 
 		 537 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  56.33 
 
 		 531 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  57.25 
 
 		 565 aa  626  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  55.87 
 
 		 533 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  54.39 
 
 		 542 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  54.49 
 
 		 535 aa  623  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.58 
 
 		 531 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  57.68 
 
 		 564 aa  621  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.66 
 
 		 536 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  56.33 
 
 		 532 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.66 
 
 		 536 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  54.46 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  54.9 
 
 		 545 aa  616  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  56.19 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  54.98 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.91 
 
 		 534 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  54.44 
 
 		 530 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  55.17 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  53.88 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  53.93 
 
 		 555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.97 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  53.93 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  55.11 
 
 		 536 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  54.66 
 
 		 538 aa  598  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  56.19 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.75 
 
 		 555 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  53.54 
 
 		 534 aa  601  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.45 
 
 		 558 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  53.18 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  53.79 
 
 		 535 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  53.79 
 
 		 535 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.34 
 
 		 555 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  54.36 
 
 		 549 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  55.58 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  53.08 
 
 		 550 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  54.8 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  54.27 
 
 		 554 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  52.55 
 
 		 546 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.36 
 
 		 542 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  52.48 
 
 		 552 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.41 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  51.42 
 
 		 547 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  53 
 
 		 551 aa  589  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  53.94 
 
 		 547 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  56.33 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  51.23 
 
 		 547 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  51.89 
 
 		 534 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  52.3 
 
 		 542 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  53.61 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  52.3 
 
 		 542 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.18 
 
 		 534 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  51.96 
 
 		 549 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  52.44 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  53.47 
 
 		 533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  52.14 
 
 		 534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  51.22 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  52.32 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  53.4 
 
 		 537 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  52.32 
 
 		 543 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  51.3 
 
 		 534 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  53.92 
 
 		 548 aa  581  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  52.32 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>