More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1439 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.99 
 
 
535 aa  642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  100 
 
 
545 aa  1107    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  69.14 
 
 
553 aa  776    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  55.97 
 
 
535 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  55.97 
 
 
535 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.24 
 
 
542 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  88.52 
 
 
555 aa  990    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.4 
 
 
541 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.74 
 
 
536 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.59 
 
 
534 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.38 
 
 
533 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.62 
 
 
531 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.16 
 
 
533 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  54.77 
 
 
531 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.22 
 
 
535 aa  614  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.22 
 
 
535 aa  614  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  57.7 
 
 
551 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  55.41 
 
 
532 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.22 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.85 
 
 
535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  54.07 
 
 
547 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.04 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  53.89 
 
 
547 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.85 
 
 
537 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  54.85 
 
 
535 aa  611  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.35 
 
 
533 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.05 
 
 
534 aa  608  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.85 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.75 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54.97 
 
 
546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  54.71 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  54.34 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  52.88 
 
 
533 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  53.16 
 
 
542 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  53.8 
 
 
537 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.03 
 
 
559 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.49 
 
 
545 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  53.85 
 
 
545 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  55.14 
 
 
549 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55 
 
 
555 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.21 
 
 
558 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  55.2 
 
 
535 aa  595  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  55.13 
 
 
555 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  54.39 
 
 
555 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  53.83 
 
 
555 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  55.33 
 
 
549 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  52.88 
 
 
538 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  52.6 
 
 
538 aa  591  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  53.95 
 
 
555 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.83 
 
 
542 aa  595  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.87 
 
 
534 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  54.95 
 
 
555 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  53.33 
 
 
557 aa  588  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  54.29 
 
 
533 aa  588  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  53.14 
 
 
535 aa  585  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  54.19 
 
 
551 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  53.41 
 
 
536 aa  585  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  54.48 
 
 
555 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  54.26 
 
 
569 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  52.81 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  54.14 
 
 
549 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  51.67 
 
 
533 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  52.13 
 
 
536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  54.77 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  52.32 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  53.73 
 
 
608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  52.13 
 
 
536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.6 
 
 
534 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  53.43 
 
 
536 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  54.43 
 
 
554 aa  578  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  55.2 
 
 
530 aa  581  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  54.56 
 
 
538 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  51.95 
 
 
536 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  55.23 
 
 
555 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  51.76 
 
 
536 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  53.58 
 
 
567 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  53.53 
 
 
539 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.12 
 
 
534 aa  580  1e-164  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  55.21 
 
 
558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  51.02 
 
 
536 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  54.12 
 
 
652 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  53.19 
 
 
542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  51.03 
 
 
539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  53.59 
 
 
550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  51.18 
 
 
571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  54.21 
 
 
540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  53 
 
 
547 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  52.5 
 
 
534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  51.39 
 
 
536 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  54.58 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  49.81 
 
 
534 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  52.77 
 
 
554 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  51.1 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  53.6 
 
 
555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  53.16 
 
 
530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>