More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0012 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  100 
 
 		 545 aa  1110    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  86.62 
 
 		 543 aa  962    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  80.81 
 
 		 544 aa  909    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  86.62 
 
 		 543 aa  961    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2080  CTP synthetase  64.49 
 
 		 542 aa  731    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  86.62 
 
 		 543 aa  962    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  74.72 
 
 		 546 aa  849    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  76.67 
 
 		 541 aa  876    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  81 
 
 		 544 aa  909    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  79.85 
 
 		 546 aa  900    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  56.48 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.62 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  56.01 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  55.84 
 
 		 547 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.59 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.14 
 
 		 536 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  55.88 
 
 		 542 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.62 
 
 		 543 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  56.09 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.07 
 
 		 542 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  56.22 
 
 		 531 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  55.88 
 
 		 542 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  55.88 
 
 		 542 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  55.84 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  56.09 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  56.27 
 
 		 543 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.13 
 
 		 542 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  55.97 
 
 		 543 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  55.68 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  55.64 
 
 		 542 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  52.85 
 
 		 547 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.66 
 
 		 531 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.68 
 
 		 542 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.92 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.68 
 
 		 542 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  58.04 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  53.41 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  55.54 
 
 		 547 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.65 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  56.07 
 
 		 538 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.73 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.72 
 
 		 533 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  54.16 
 
 		 539 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  55.12 
 
 		 543 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  55.19 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.08 
 
 		 535 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  54.83 
 
 		 537 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  52.67 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  55.37 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.9 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.98 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.08 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  54.9 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  54.71 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  54.71 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  54.78 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.54 
 
 		 533 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  54.71 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  55.84 
 
 		 548 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.08 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  55.19 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  54.71 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  54.43 
 
 		 543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  55.33 
 
 		 543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  54.41 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  53.31 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  55.02 
 
 		 544 aa  601  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  54.28 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  54.83 
 
 		 544 aa  601  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  54.53 
 
 		 535 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  54.75 
 
 		 555 aa  599  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  54.75 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  55.8 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  56.67 
 
 		 545 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  54.24 
 
 		 543 aa  596  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  53.42 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.64 
 
 		 547 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  56.27 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.63 
 
 		 534 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  55.1 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  54.34 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  55.08 
 
 		 535 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  54.24 
 
 		 549 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  56.48 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  55.54 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  53.89 
 
 		 554 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  56.69 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.29 
 
 		 536 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  53.8 
 
 		 534 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  54.96 
 
 		 566 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  53.53 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  53.62 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  56.69 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.43 
 
 		 534 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  54.48 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.62 
 
 		 545 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  53.62 
 
 		 534 aa  589  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  52.48 
 
 		 558 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  54.51 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  54.51 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>