More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1955 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  63.4 
 
 
542 aa  696    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  83.46 
 
 
531 aa  923    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  100 
 
 
530 aa  1077    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  86.74 
 
 
528 aa  943    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  85.63 
 
 
530 aa  952    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  58.27 
 
 
535 aa  619  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  58.61 
 
 
531 aa  612  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  57.55 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.18 
 
 
533 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.99 
 
 
533 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.7 
 
 
533 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  54.99 
 
 
533 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  54.44 
 
 
536 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.86 
 
 
531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.34 
 
 
559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.86 
 
 
534 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  54.8 
 
 
533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.86 
 
 
531 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  53.48 
 
 
541 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  54.24 
 
 
534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  55.76 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.23 
 
 
542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.92 
 
 
542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  54.53 
 
 
550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  53.98 
 
 
534 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  53.69 
 
 
534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  52.21 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  52.21 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  52.5 
 
 
543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  53.48 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.43 
 
 
537 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  52.03 
 
 
542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  52.06 
 
 
535 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  52.06 
 
 
535 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  52.51 
 
 
535 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  51.5 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  51.69 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  51.69 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  52.92 
 
 
542 aa  567  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  51.69 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  51.89 
 
 
545 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  51.69 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  51.85 
 
 
542 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  52.17 
 
 
547 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  51.5 
 
 
535 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  53.98 
 
 
540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  53.43 
 
 
552 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  54.31 
 
 
552 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  51.6 
 
 
533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  52.41 
 
 
543 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  52.17 
 
 
547 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  52.6 
 
 
542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  51.31 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  55.2 
 
 
545 aa  561  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  52.4 
 
 
543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  53.72 
 
 
553 aa  564  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  51.5 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  52.73 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  52.73 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  51.87 
 
 
532 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  52.6 
 
 
542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  51.31 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  52.64 
 
 
555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  53.26 
 
 
546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  53.01 
 
 
557 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  53.21 
 
 
555 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  52.41 
 
 
543 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  50.57 
 
 
536 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  52.93 
 
 
549 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  558  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  53.21 
 
 
555 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  52.49 
 
 
542 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  52.93 
 
 
558 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  52.04 
 
 
547 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  50.57 
 
 
536 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  53.4 
 
 
555 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  51.76 
 
 
542 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  53.04 
 
 
536 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  52.46 
 
 
547 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  53.2 
 
 
551 aa  555  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  52.8 
 
 
545 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  52.45 
 
 
530 aa  555  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  51.2 
 
 
555 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  51.33 
 
 
534 aa  558  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  52.61 
 
 
545 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  52.93 
 
 
549 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  52.92 
 
 
538 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  50 
 
 
555 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  53.07 
 
 
608 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  51.04 
 
 
539 aa  551  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  51.2 
 
 
543 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  52.13 
 
 
549 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  52.53 
 
 
554 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  49.81 
 
 
538 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  53.01 
 
 
555 aa  555  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.44 
 
 
555 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  50.66 
 
 
558 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  50.83 
 
 
555 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  52.17 
 
 
545 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>