More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0799 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  85.63 
 
 
530 aa  952    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  87.69 
 
 
528 aa  956    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  60.91 
 
 
542 aa  675    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  100 
 
 
530 aa  1080    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  82.2 
 
 
531 aa  927    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  56.39 
 
 
535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.17 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  58.46 
 
 
531 aa  593  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  52.93 
 
 
531 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  53.96 
 
 
541 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  53.22 
 
 
536 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  53.57 
 
 
533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  55.02 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  52.44 
 
 
533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  53.95 
 
 
533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.48 
 
 
534 aa  579  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  53.2 
 
 
533 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  51.85 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  51.89 
 
 
531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  51.42 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  51.96 
 
 
543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  51.67 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  50.47 
 
 
547 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  51.85 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  50.28 
 
 
547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.01 
 
 
534 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  51.67 
 
 
542 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  51.51 
 
 
535 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  51.32 
 
 
535 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  51.57 
 
 
542 aa  570  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  51.51 
 
 
535 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  51.8 
 
 
546 aa  568  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  52.75 
 
 
558 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  52.17 
 
 
537 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  52.17 
 
 
534 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  51.89 
 
 
542 aa  571  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  51.22 
 
 
542 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  53.38 
 
 
550 aa  569  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  50.94 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  51.96 
 
 
543 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  51.86 
 
 
542 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  52.63 
 
 
534 aa  568  1e-160  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  52.74 
 
 
549 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  51.78 
 
 
535 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  52.08 
 
 
559 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  51.86 
 
 
542 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  51.13 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.42 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  51.77 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  52.65 
 
 
533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  50.75 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  51.52 
 
 
555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  51.9 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  50.94 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  51.71 
 
 
555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  52.6 
 
 
553 aa  562  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  50.85 
 
 
535 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  50.85 
 
 
535 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  51.85 
 
 
543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  52.37 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  50.85 
 
 
538 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  51.33 
 
 
555 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  50.66 
 
 
536 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.43 
 
 
558 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  52.51 
 
 
546 aa  561  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  51.51 
 
 
532 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  51.11 
 
 
543 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  52.06 
 
 
552 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  52.17 
 
 
534 aa  555  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  50.95 
 
 
536 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  50.95 
 
 
536 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  50.76 
 
 
535 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  51.42 
 
 
547 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.89 
 
 
555 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  53.6 
 
 
551 aa  553  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  50.09 
 
 
536 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  50.09 
 
 
536 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  51.97 
 
 
552 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  53.16 
 
 
545 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  50.95 
 
 
549 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  50.94 
 
 
554 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  51.61 
 
 
540 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  51.72 
 
 
555 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  50.75 
 
 
536 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  50.94 
 
 
538 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  51.11 
 
 
542 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  49.63 
 
 
542 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  51.51 
 
 
555 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  50.66 
 
 
537 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.24 
 
 
534 aa  546  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  51.42 
 
 
555 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  51.22 
 
 
535 aa  548  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  50 
 
 
536 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  51.88 
 
 
537 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  50.76 
 
 
539 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  49.06 
 
 
534 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>