More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0862 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  59.67 
 
 
526 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  59.74 
 
 
562 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  65.56 
 
 
534 aa  682    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  67.48 
 
 
534 aa  733    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  58.88 
 
 
551 aa  637    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  59.74 
 
 
550 aa  649    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  100 
 
 
546 aa  1122    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  60.07 
 
 
552 aa  642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  59.18 
 
 
568 aa  633  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  60.52 
 
 
525 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  60.41 
 
 
534 aa  627  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  58.55 
 
 
529 aa  617  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  57.99 
 
 
527 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  57.14 
 
 
527 aa  611  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  54.88 
 
 
541 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.83 
 
 
536 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.29 
 
 
533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.89 
 
 
531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  53.2 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  54.55 
 
 
533 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  53.01 
 
 
547 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.36 
 
 
531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  54.49 
 
 
533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.61 
 
 
537 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  53.93 
 
 
533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  53.01 
 
 
558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  53.46 
 
 
535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  51.76 
 
 
542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  52.88 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  54.17 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.82 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.01 
 
 
535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.8 
 
 
534 aa  570  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  52.13 
 
 
536 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.44 
 
 
542 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.38 
 
 
534 aa  568  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  52.13 
 
 
536 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  52.58 
 
 
535 aa  566  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  53.7 
 
 
555 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.56 
 
 
540 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  52.44 
 
 
535 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.09 
 
 
542 aa  568  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  53.01 
 
 
528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  52.15 
 
 
546 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  53.26 
 
 
530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  52.7 
 
 
532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.36 
 
 
559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  54.48 
 
 
547 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  51.2 
 
 
536 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  51.31 
 
 
555 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  53.39 
 
 
553 aa  561  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  51.58 
 
 
531 aa  558  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  52.51 
 
 
530 aa  561  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  50.94 
 
 
555 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  51.88 
 
 
535 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  51.88 
 
 
535 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  50.84 
 
 
534 aa  554  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  51.84 
 
 
538 aa  552  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  50.37 
 
 
538 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  51.74 
 
 
549 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  50.09 
 
 
571 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  50.75 
 
 
558 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  51.64 
 
 
555 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  51.59 
 
 
534 aa  552  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  51.64 
 
 
557 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  51.68 
 
 
533 aa  549  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  51.88 
 
 
534 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  50.56 
 
 
549 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  53.08 
 
 
531 aa  550  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  51.19 
 
 
536 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  51.77 
 
 
547 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  50.46 
 
 
555 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  50.38 
 
 
533 aa  548  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  51.83 
 
 
547 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  52.9 
 
 
551 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  52.65 
 
 
540 aa  545  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  51.87 
 
 
538 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  52.15 
 
 
545 aa  548  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  52.93 
 
 
537 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  49.37 
 
 
549 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  50.19 
 
 
536 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  49.91 
 
 
542 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  52.42 
 
 
555 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  51.31 
 
 
535 aa  539  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  49.81 
 
 
533 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  50 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  51.95 
 
 
563 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  51.87 
 
 
554 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  49.44 
 
 
536 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  49.81 
 
 
534 aa  537  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  49.53 
 
 
536 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>