More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2594 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  78.21 
 
 		 568 aa  890    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  82.68 
 
 		 550 aa  932    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  58.98 
 
 		 534 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  100 
 
 		 551 aa  1121    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  58.88 
 
 		 546 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  78.58 
 
 		 562 aa  885    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  78.75 
 
 		 552 aa  885    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  57.36 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  56.9 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  58.63 
 
 		 534 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.32 
 
 		 541 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  56.34 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  56.23 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  56.93 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  53.87 
 
 		 542 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  55.45 
 
 		 533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  53.46 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  54.75 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  54.75 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.02 
 
 		 533 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.08 
 
 		 534 aa  578  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  55.01 
 
 		 527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  53.11 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  53.46 
 
 		 533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  51.42 
 
 		 533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.43 
 
 		 531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.97 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  54.05 
 
 		 531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  52.82 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  52.54 
 
 		 536 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  52.54 
 
 		 536 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  53.77 
 
 		 538 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  54.19 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  54.32 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.06 
 
 		 537 aa  561  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  53.66 
 
 		 532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.21 
 
 		 534 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  55.37 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  52.43 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  52.97 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  52.35 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  52.24 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  53.96 
 
 		 531 aa  555  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  53.67 
 
 		 536 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  52.24 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  53.2 
 
 		 530 aa  555  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  51.19 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  54.26 
 
 		 551 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  53.35 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.17 
 
 		 542 aa  557  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  53.67 
 
 		 533 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  52.26 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.03 
 
 		 540 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  51.77 
 
 		 545 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  51.87 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  52.17 
 
 		 547 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  51.01 
 
 		 555 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  52.63 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  52.05 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  53.6 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  51.03 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.37 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  52.91 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  51.42 
 
 		 554 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.35 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  52.72 
 
 		 546 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  51.18 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  51.98 
 
 		 547 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  54.34 
 
 		 608 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  50.85 
 
 		 536 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  53.72 
 
 		 554 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  50.38 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  52.31 
 
 		 542 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  51.52 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  51.21 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  51.4 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  52.64 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.15 
 
 		 549 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  51.4 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  52.64 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  51.48 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  51.4 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  51.89 
 
 		 530 aa  543  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.09 
 
 		 559 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  52.11 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  51.88 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  52.33 
 
 		 545 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  52.33 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00220  CTP synthase, putative  50.18 
 
 		 625 aa  538  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  51.66 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  51.22 
 
 		 538 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  51.41 
 
 		 544 aa  540  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.21 
 
 		 545 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  50.56 
 
 		 543 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>