More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1899 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  69.08 
 
 
527 aa  747    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  100 
 
 
529 aa  1088    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  71.54 
 
 
527 aa  781    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  73.14 
 
 
525 aa  790    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  74.14 
 
 
526 aa  813    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  58.36 
 
 
534 aa  631  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  58.25 
 
 
568 aa  615  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  56.61 
 
 
550 aa  615  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  58.55 
 
 
546 aa  617  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  58.11 
 
 
562 aa  611  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  58.36 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  56.34 
 
 
551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  56.42 
 
 
534 aa  600  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  55.84 
 
 
534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  52.06 
 
 
531 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  50.65 
 
 
535 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  50.65 
 
 
535 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  52.72 
 
 
531 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  50.84 
 
 
535 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  50.65 
 
 
535 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  52.52 
 
 
533 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  52.83 
 
 
553 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  52.52 
 
 
540 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  51.22 
 
 
536 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  51.77 
 
 
533 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  52.54 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  52.04 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  51.3 
 
 
541 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  51.4 
 
 
535 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  51.41 
 
 
546 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  51.21 
 
 
533 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  50 
 
 
533 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  51.12 
 
 
534 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  50.19 
 
 
534 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  50.28 
 
 
536 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  50.28 
 
 
536 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  49.91 
 
 
547 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.43 
 
 
558 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  50.73 
 
 
542 aa  533  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  50.56 
 
 
533 aa  535  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.13 
 
 
545 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  50.65 
 
 
532 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  51.03 
 
 
535 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  51.03 
 
 
535 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  49.72 
 
 
547 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  50.37 
 
 
535 aa  528  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  49.91 
 
 
534 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  50.82 
 
 
542 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50.37 
 
 
542 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  51.87 
 
 
537 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  49.91 
 
 
551 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.44 
 
 
533 aa  525  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.07 
 
 
534 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  51.04 
 
 
531 aa  520  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  51.76 
 
 
533 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  49.25 
 
 
559 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  49.53 
 
 
534 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  48.88 
 
 
533 aa  521  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  50.56 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  50.46 
 
 
543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  48.79 
 
 
538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  51.89 
 
 
547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  49.72 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  50.74 
 
 
542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  49.63 
 
 
547 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  50.37 
 
 
540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  50.74 
 
 
542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  50 
 
 
543 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  49.81 
 
 
555 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  49.35 
 
 
534 aa  512  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  49.91 
 
 
542 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  50.19 
 
 
551 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  49.45 
 
 
555 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  49.91 
 
 
555 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  49.54 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  48.22 
 
 
534 aa  509  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  49.81 
 
 
555 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  49.54 
 
 
546 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  48.38 
 
 
534 aa  509  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  49.63 
 
 
549 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  49.91 
 
 
549 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  50.84 
 
 
528 aa  509  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  50.47 
 
 
548 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  49.44 
 
 
530 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  49.54 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  49.54 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  49.34 
 
 
531 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  48.7 
 
 
536 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  50.19 
 
 
543 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  48.88 
 
 
536 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  51.12 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  51.67 
 
 
569 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  48.81 
 
 
545 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>