More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0070 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  73.04 
 
 
527 aa  784    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  73.14 
 
 
529 aa  790    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  70.48 
 
 
527 aa  753    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  100 
 
 
525 aa  1074    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  74.86 
 
 
526 aa  816    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  60.52 
 
 
546 aa  630  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  58.91 
 
 
534 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  58.47 
 
 
552 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  57.77 
 
 
550 aa  601  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  56.74 
 
 
568 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  57.58 
 
 
562 aa  591  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  56.98 
 
 
534 aa  585  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  56.93 
 
 
551 aa  587  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  58.91 
 
 
534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.39 
 
 
533 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.1 
 
 
531 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  55.14 
 
 
540 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  51.98 
 
 
535 aa  548  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  53.92 
 
 
536 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.38 
 
 
531 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  51.87 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  53 
 
 
535 aa  543  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.05 
 
 
535 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  52.05 
 
 
535 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  51.87 
 
 
535 aa  545  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  52.7 
 
 
535 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  51.49 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.05 
 
 
533 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.26 
 
 
558 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  52.11 
 
 
542 aa  535  1e-151  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  49.91 
 
 
536 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  51.87 
 
 
547 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  49.15 
 
 
533 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  53.83 
 
 
531 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  51.68 
 
 
541 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  49.91 
 
 
536 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  52.05 
 
 
533 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  52.21 
 
 
553 aa  535  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.39 
 
 
547 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  51.68 
 
 
547 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.8 
 
 
534 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  53.57 
 
 
537 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  51.31 
 
 
533 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  53.37 
 
 
533 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  51.02 
 
 
534 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  50.28 
 
 
536 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  49.81 
 
 
534 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  51.32 
 
 
545 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  52.07 
 
 
547 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  51.87 
 
 
534 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  51.7 
 
 
534 aa  521  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.8 
 
 
545 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.87 
 
 
555 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  51.87 
 
 
532 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50.85 
 
 
542 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.09 
 
 
559 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  50.19 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  51.41 
 
 
551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  49.81 
 
 
534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  52.06 
 
 
530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  49.72 
 
 
555 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  52.79 
 
 
546 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  49.72 
 
 
555 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.72 
 
 
533 aa  514  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  50.65 
 
 
555 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  49.16 
 
 
537 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  53.66 
 
 
528 aa  514  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  50.94 
 
 
557 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  52.26 
 
 
544 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  50.37 
 
 
536 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  50.09 
 
 
555 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  50.65 
 
 
555 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  50.65 
 
 
549 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  49.34 
 
 
533 aa  510  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  50.84 
 
 
542 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  52.62 
 
 
530 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  50.55 
 
 
569 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  50.65 
 
 
555 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  51.87 
 
 
537 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  52.44 
 
 
544 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  50.74 
 
 
555 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  48.51 
 
 
534 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  50.37 
 
 
560 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  49.91 
 
 
555 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  51.22 
 
 
538 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  52.44 
 
 
544 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  50.19 
 
 
535 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  50.19 
 
 
535 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  47.72 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  49.91 
 
 
542 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  49.91 
 
 
542 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  50.09 
 
 
558 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  51.02 
 
 
566 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  49.72 
 
 
542 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>