More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3518 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  100 
 
 		 534 aa  1094    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  72.93 
 
 		 534 aa  829    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  58.14 
 
 		 550 aa  642    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  65.56 
 
 		 546 aa  705    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  58.63 
 
 		 551 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  59.85 
 
 		 534 aa  630  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  56.88 
 
 		 552 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  59.18 
 
 		 526 aa  628  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  57.25 
 
 		 562 aa  625  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  56.52 
 
 		 568 aa  611  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  58.91 
 
 		 525 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  55.84 
 
 		 529 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  57.17 
 
 		 527 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.39 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  55.12 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  56.69 
 
 		 527 aa  591  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.64 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  53.99 
 
 		 542 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.45 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  53.73 
 
 		 542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  53.92 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.77 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.77 
 
 		 534 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  54.68 
 
 		 536 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  54.68 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.51 
 
 		 533 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.15 
 
 		 531 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.55 
 
 		 547 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  54.78 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  52.43 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  54.92 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  51.12 
 
 		 536 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  51.12 
 
 		 536 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  54.65 
 
 		 553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.91 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  53.23 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  53.02 
 
 		 547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  52.93 
 
 		 537 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  54.43 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.83 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  53.56 
 
 		 540 aa  571  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.13 
 
 		 535 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  51.89 
 
 		 559 aa  568  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.51 
 
 		 535 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  52.34 
 
 		 534 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.32 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.04 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  52.33 
 
 		 551 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  51.59 
 
 		 534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  51.31 
 
 		 534 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  51.12 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  52.04 
 
 		 557 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  51.78 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  52.56 
 
 		 546 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  52.73 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  52.53 
 
 		 533 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  51.7 
 
 		 535 aa  558  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  52.51 
 
 		 536 aa  555  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  51.8 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  51.8 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  52.85 
 
 		 545 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.48 
 
 		 555 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  51.14 
 
 		 555 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  51.52 
 
 		 558 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  52.74 
 
 		 528 aa  554  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  52.08 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  51.11 
 
 		 571 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  50.75 
 
 		 533 aa  553  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  51.5 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  51.33 
 
 		 536 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  51.14 
 
 		 536 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  52.14 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  50.57 
 
 		 549 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  51.52 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  52.14 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  52.45 
 
 		 531 aa  548  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  51.21 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  51.58 
 
 		 544 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  51.24 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  52.83 
 
 		 537 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  52.82 
 
 		 532 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  52.17 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  51.02 
 
 		 547 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  52.73 
 
 		 530 aa  548  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  51.23 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  51.5 
 
 		 549 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  50.09 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  50.93 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  50.93 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  50.28 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  50.56 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  51.12 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>