More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2140 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  100 
 
 		 526 aa  1082    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  74.14 
 
 		 529 aa  813    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  73.61 
 
 		 527 aa  804    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  60.04 
 
 		 534 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  70.48 
 
 		 527 aa  758    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  59.67 
 
 		 546 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  74.86 
 
 		 525 aa  816    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  58.33 
 
 		 550 aa  621  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  58.49 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  58.06 
 
 		 568 aa  609  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  58.52 
 
 		 562 aa  609  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  56.9 
 
 		 551 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  59.18 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  58.38 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  50.55 
 
 		 542 aa  549  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  53.36 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.42 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  52.89 
 
 		 541 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  52.92 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.4 
 
 		 531 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  52.61 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  50.84 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  50.84 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  50.56 
 
 		 533 aa  541  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  50.84 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  51.6 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  51.12 
 
 		 533 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  50.84 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  51.99 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  52.35 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  50.84 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  51.86 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  50.93 
 
 		 533 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  51.59 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  50.56 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  51.04 
 
 		 547 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  51.32 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  50.19 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  53.28 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  50.85 
 
 		 547 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  51.32 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  49.72 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.81 
 
 		 558 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  52.91 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  52.08 
 
 		 533 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  50.38 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  50.09 
 
 		 546 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  50 
 
 		 545 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  50.38 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  51.59 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  49.63 
 
 		 535 aa  525  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  49.72 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  50.94 
 
 		 547 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.19 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  50.55 
 
 		 553 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  51.49 
 
 		 531 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  50.47 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  50.47 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  49.81 
 
 		 542 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  50.09 
 
 		 534 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  50 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  49.62 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  50.38 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  51.41 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  50.94 
 
 		 551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  47.82 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  50.56 
 
 		 537 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.44 
 
 		 533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  51.04 
 
 		 528 aa  512  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  53.16 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  50.09 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  50.55 
 
 		 555 aa  511  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  50.65 
 
 		 545 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  49.25 
 
 		 555 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  48.62 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  48.13 
 
 		 536 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  49.35 
 
 		 555 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  49.53 
 
 		 555 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  49.25 
 
 		 555 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  50 
 
 		 560 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  47.78 
 
 		 538 aa  508  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  50.47 
 
 		 530 aa  511  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  50.37 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  49.72 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  50.46 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  51.51 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  47.93 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  48.51 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  50.57 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  47.74 
 
 		 536 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  49.16 
 
 		 557 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  48.26 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  50.18 
 
 		 555 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  49.54 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>