More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00220 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00490  CTP synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05210)  61.48 
 
 
583 aa  731    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.339989  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00220  CTP synthase, putative  100 
 
 
625 aa  1291    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78143  CTP synthase  62.2 
 
 
573 aa  770    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28993  CTP synthase  58.17 
 
 
587 aa  615  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50034  predicted protein  53.32 
 
 
547 aa  608  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0110404  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  49.73 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  50.18 
 
 
551 aa  538  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  48.84 
 
 
550 aa  538  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  49.37 
 
 
568 aa  532  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  49.37 
 
 
534 aa  523  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  48.11 
 
 
552 aa  518  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  48.12 
 
 
534 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  48.03 
 
 
533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  47.67 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  45.96 
 
 
546 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.31 
 
 
537 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  47.67 
 
 
533 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  45.89 
 
 
542 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  47.07 
 
 
546 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  44.29 
 
 
558 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  45.52 
 
 
534 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  46.42 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  44.19 
 
 
535 aa  490  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  46 
 
 
555 aa  490  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  44.72 
 
 
536 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  46.42 
 
 
541 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  45.08 
 
 
531 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  44.01 
 
 
547 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  44.01 
 
 
547 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  44.72 
 
 
536 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  45.85 
 
 
536 aa  485  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  44.64 
 
 
534 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  44.36 
 
 
555 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  48.57 
 
 
534 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  46.15 
 
 
545 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  45.26 
 
 
531 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  44.36 
 
 
555 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  44.34 
 
 
535 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  44.34 
 
 
535 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  44.9 
 
 
555 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  45.02 
 
 
545 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  46.03 
 
 
553 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  45.78 
 
 
527 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  43.77 
 
 
535 aa  476  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  45.7 
 
 
534 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  43.65 
 
 
535 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  44.9 
 
 
558 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  45.89 
 
 
533 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  45.28 
 
 
557 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  43.86 
 
 
566 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  44.29 
 
 
535 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  46.76 
 
 
547 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  45.97 
 
 
534 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  45.08 
 
 
533 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  43.32 
 
 
532 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  44.36 
 
 
549 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  44.01 
 
 
549 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  44.23 
 
 
608 aa  475  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  42.22 
 
 
533 aa  474  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  46.24 
 
 
551 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  43.49 
 
 
571 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  45.08 
 
 
536 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  43.86 
 
 
544 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  44.46 
 
 
549 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  43.57 
 
 
534 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  44.11 
 
 
535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  44.97 
 
 
558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  44.72 
 
 
533 aa  472  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  43.14 
 
 
535 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  45.55 
 
 
530 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  45.21 
 
 
531 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  41.75 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  44.82 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  43.65 
 
 
536 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  43.29 
 
 
536 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  43.76 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  43.03 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  44.74 
 
 
532 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  45.1 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  43.32 
 
 
535 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  44.01 
 
 
536 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  43.29 
 
 
534 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  43.14 
 
 
534 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  45.66 
 
 
549 aa  465  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  43.26 
 
 
563 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  43.85 
 
 
558 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  43.78 
 
 
552 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  44.17 
 
 
555 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  44.54 
 
 
547 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  41.83 
 
 
555 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  43.78 
 
 
552 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  43.78 
 
 
552 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>