More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4426 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  52.63 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  46.93 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  48.25 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  48 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  48.21 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  42.98 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  42.66 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  31.85 
 
 		 535 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  32.4 
 
 		 534 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  34.53 
 
 		 531 aa  111  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  30.96 
 
 		 540 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  31.22 
 
 		 562 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  28.92 
 
 		 543 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  28.92 
 
 		 543 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  29.95 
 
 		 533 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  30.4 
 
 		 565 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  27.91 
 
 		 543 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  31.4 
 
 		 563 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  31.36 
 
 		 550 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  27.71 
 
 		 554 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  30.64 
 
 		 568 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  27.31 
 
 		 541 aa  105  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  30.24 
 
 		 533 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0588  CTP synthetase  30.96 
 
 		 533 aa  104  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  32.14 
 
 		 526 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  33.05 
 
 		 531 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  33.8 
 
 		 525 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  28.85 
 
 		 550 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  33.05 
 
 		 546 aa  101  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  29.92 
 
 		 533 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  30.47 
 
 		 545 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  30.47 
 
 		 545 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  32.64 
 
 		 549 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  31.38 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  27.02 
 
 		 546 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  30.2 
 
 		 533 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  32.22 
 
 		 555 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  32.22 
 
 		 555 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  32.05 
 
 		 597 aa  99.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  33.05 
 
 		 549 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  28.29 
 
 		 536 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  28.29 
 
 		 536 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  31.22 
 
 		 551 aa  98.6  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  27.71 
 
 		 545 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  27.49 
 
 		 535 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  29.69 
 
 		 551 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  29.8 
 
 		 533 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  29.91 
 
 		 529 aa  96.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  28.69 
 
 		 547 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  29.36 
 
 		 565 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  29.88 
 
 		 530 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  28.69 
 
 		 547 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  27.38 
 
 		 537 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  27.67 
 
 		 535 aa  95.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  27.38 
 
 		 547 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  30.45 
 
 		 530 aa  95.1  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  27.67 
 
 		 535 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  27.87 
 
 		 534 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  29 
 
 		 534 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  29.08 
 
 		 542 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  27.67 
 
 		 535 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  30.29 
 
 		 545 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  28.74 
 
 		 550 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  27.67 
 
 		 535 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  27.27 
 
 		 535 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  31.54 
 
 		 528 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  26.91 
 
 		 544 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  29.48 
 
 		 536 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  27.27 
 
 		 535 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  31.8 
 
 		 558 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  27.27 
 
 		 535 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  26.88 
 
 		 535 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  27.27 
 
 		 535 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  28.69 
 
 		 538 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  27.97 
 
 		 555 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  26.88 
 
 		 535 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  28.29 
 
 		 531 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  27.27 
 
 		 535 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  29.84 
 
 		 548 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  29.11 
 
 		 552 aa  91.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  29.31 
 
 		 546 aa  91.7  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  29.74 
 
 		 536 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  27.24 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  28.93 
 
 		 535 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  29.27 
 
 		 531 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  26.98 
 
 		 553 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  27.38 
 
 		 552 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  27.24 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  28.11 
 
 		 534 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  30.24 
 
 		 560 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  27.97 
 
 		 550 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  26.98 
 
 		 557 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  30.23 
 
 		 527 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  27.13 
 
 		 543 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  28.12 
 
 		 549 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  27.97 
 
 		 553 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>