More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3240 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  77.31 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  57.46 
 
 		 235 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  50.88 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  51.34 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  48 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  47.32 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  45.78 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  45.78 
 
 		 356 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  44.44 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  47.12 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  30.28 
 
 		 565 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  31.08 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  28.97 
 
 		 539 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  28.8 
 
 		 535 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  32.24 
 
 		 531 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  27.76 
 
 		 554 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  28.86 
 
 		 535 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  31.71 
 
 		 533 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  31.93 
 
 		 562 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  28 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  28 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  26.88 
 
 		 545 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  29.96 
 
 		 558 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  29.34 
 
 		 534 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  31.65 
 
 		 526 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  29.76 
 
 		 535 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  33.47 
 
 		 525 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  27.46 
 
 		 537 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  29.39 
 
 		 550 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  30.4 
 
 		 549 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  27.8 
 
 		 534 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  31.17 
 
 		 540 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  29.58 
 
 		 535 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  29.58 
 
 		 535 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  29.96 
 
 		 568 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  29.39 
 
 		 531 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  27.67 
 
 		 544 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  30.36 
 
 		 532 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  29.55 
 
 		 535 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  29.64 
 
 		 549 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  28.86 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  27.53 
 
 		 558 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  29.22 
 
 		 534 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  31.85 
 
 		 529 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  26.4 
 
 		 541 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  28.35 
 
 		 543 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  28.17 
 
 		 547 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  27.16 
 
 		 536 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  30.98 
 
 		 587 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  29.22 
 
 		 547 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  25 
 
 		 543 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  27.56 
 
 		 542 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  28.35 
 
 		 543 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  25 
 
 		 543 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  27.56 
 
 		 542 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  29.72 
 
 		 543 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  29.22 
 
 		 547 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  29.96 
 
 		 555 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  28.93 
 
 		 536 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  27.16 
 
 		 539 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  29.15 
 
 		 535 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  27.31 
 
 		 563 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  29.37 
 
 		 553 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  27.16 
 
 		 536 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  29.88 
 
 		 537 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  27.53 
 
 		 545 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  28.27 
 
 		 555 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  27.87 
 
 		 534 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  28.86 
 
 		 535 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  25.69 
 
 		 546 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  29.29 
 
 		 534 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  27.17 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  31.78 
 
 		 527 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  27.45 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  28.27 
 
 		 555 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  26.09 
 
 		 543 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  29.41 
 
 		 597 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  26.69 
 
 		 538 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  27.45 
 
 		 542 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  28.97 
 
 		 546 aa  99.8  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  27.16 
 
 		 536 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  26.02 
 
 		 533 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  28.24 
 
 		 547 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  27.45 
 
 		 542 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  30.17 
 
 		 536 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  28.81 
 
 		 549 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  28.03 
 
 		 547 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  27.56 
 
 		 542 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  27.56 
 
 		 542 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  28.46 
 
 		 545 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  28.46 
 
 		 545 aa  98.6  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  25.93 
 
 		 533 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  28.46 
 
 		 545 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>