More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4529 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  47.79 
 
 
239 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  45.78 
 
 
232 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  44.93 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  41.96 
 
 
232 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  44.89 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  42.49 
 
 
244 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  40.09 
 
 
231 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  41.26 
 
 
356 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  41.26 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  36.94 
 
 
230 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  38.05 
 
 
531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  32.5 
 
 
535 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  35.43 
 
 
528 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  37.37 
 
 
542 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  34.35 
 
 
551 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  34.22 
 
 
530 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  34.38 
 
 
530 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  32.14 
 
 
565 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  30.56 
 
 
554 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  37.44 
 
 
550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  31.09 
 
 
531 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  33.78 
 
 
550 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  34.56 
 
 
534 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  35.09 
 
 
546 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  32.13 
 
 
534 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  34.87 
 
 
551 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  33.33 
 
 
541 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  32.23 
 
 
568 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  31.95 
 
 
562 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  32.66 
 
 
535 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  33.96 
 
 
536 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  33.8 
 
 
545 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  33.96 
 
 
536 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  32.67 
 
 
551 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  36.71 
 
 
547 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  31.89 
 
 
545 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  33.47 
 
 
531 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  32.51 
 
 
547 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  35.12 
 
 
532 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  30.68 
 
 
539 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  31.71 
 
 
535 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  31.71 
 
 
535 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  33.33 
 
 
550 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  31.5 
 
 
545 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  32.41 
 
 
540 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  32.8 
 
 
537 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  32.53 
 
 
531 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  31.06 
 
 
533 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  34.52 
 
 
526 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  32.79 
 
 
553 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  34.18 
 
 
554 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  33.21 
 
 
559 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  32.93 
 
 
545 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  34.63 
 
 
535 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  33.33 
 
 
549 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  34.7 
 
 
558 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  30.5 
 
 
539 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  30.61 
 
 
557 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  36.08 
 
 
525 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  36.11 
 
 
581 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  33.91 
 
 
535 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  33.74 
 
 
537 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  32.41 
 
 
543 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  32.52 
 
 
546 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  35.25 
 
 
533 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  34.63 
 
 
567 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  31.67 
 
 
527 aa  99.4  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  30.61 
 
 
557 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  29.8 
 
 
541 aa  99.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  31.36 
 
 
552 aa  99  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  32.27 
 
 
558 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  31.65 
 
 
550 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  31.22 
 
 
552 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  35.2 
 
 
547 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  31.13 
 
 
587 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  31.84 
 
 
558 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  31.22 
 
 
552 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  31.22 
 
 
552 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  31.82 
 
 
549 aa  98.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  31.84 
 
 
546 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  29.44 
 
 
552 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  29.96 
 
 
543 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  35.2 
 
 
547 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  29.57 
 
 
542 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  31.39 
 
 
546 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  29.57 
 
 
542 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  32.81 
 
 
546 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  30.86 
 
 
563 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  31.31 
 
 
543 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  30.67 
 
 
544 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  34.78 
 
 
545 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  35 
 
 
548 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  31.22 
 
 
552 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  31.31 
 
 
543 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  31.78 
 
 
543 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  31.84 
 
 
546 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  31.2 
 
 
545 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  30.8 
 
 
597 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  32.27 
 
 
608 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>