More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3459 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  100 
 
 		 244 aa  493  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  77.31 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  56.03 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  51.77 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  51.1 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  48.21 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  47.56 
 
 		 356 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  47.56 
 
 		 356 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  47.77 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  44.89 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  42.53 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  31.4 
 
 		 565 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  29.88 
 
 		 537 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  29.64 
 
 		 545 aa  123  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  30.54 
 
 		 535 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  30.04 
 
 		 563 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  30.74 
 
 		 535 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  30.89 
 
 		 551 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  32.92 
 
 		 531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  31.02 
 
 		 568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  28.12 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  29.58 
 
 		 536 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  29.58 
 
 		 536 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  27.2 
 
 		 554 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  31.4 
 
 		 531 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  33.06 
 
 		 533 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  31.95 
 
 		 562 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  32.35 
 
 		 540 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  30.33 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  30.33 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  30.74 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  30.74 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  30.33 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  30.33 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  30.33 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  29.92 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  29.92 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  30.45 
 
 		 535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  32.52 
 
 		 537 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  29.48 
 
 		 544 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  36.36 
 
 		 526 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  31.54 
 
 		 547 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  31.54 
 
 		 547 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  36.11 
 
 		 525 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  29.51 
 
 		 535 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  29.51 
 
 		 535 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  30.54 
 
 		 536 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  28.63 
 
 		 546 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  30.8 
 
 		 558 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  28.81 
 
 		 545 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  29.11 
 
 		 550 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  30 
 
 		 534 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  31.25 
 
 		 532 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  30.2 
 
 		 534 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  31.01 
 
 		 545 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  31.33 
 
 		 527 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  29.88 
 
 		 530 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  27.13 
 
 		 539 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  29.41 
 
 		 541 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  27.78 
 
 		 538 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  28.8 
 
 		 541 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  26.91 
 
 		 543 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  26.91 
 
 		 543 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  28.22 
 
 		 535 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  31.93 
 
 		 549 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  28.69 
 
 		 536 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  29.75 
 
 		 534 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  33.61 
 
 		 553 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  29.3 
 
 		 542 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  30.71 
 
 		 558 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  28.27 
 
 		 536 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  26.03 
 
 		 533 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  29.41 
 
 		 555 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  30.74 
 
 		 528 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  29.41 
 
 		 555 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  27.13 
 
 		 539 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  29.17 
 
 		 545 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  28.69 
 
 		 536 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  30.17 
 
 		 534 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  29.34 
 
 		 534 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  26.91 
 
 		 543 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  29.63 
 
 		 546 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  30.04 
 
 		 554 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  30.65 
 
 		 560 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  29.76 
 
 		 597 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  30.89 
 
 		 530 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  31.8 
 
 		 549 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  31.95 
 
 		 547 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  28.87 
 
 		 538 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  28.69 
 
 		 536 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  31.82 
 
 		 551 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  28.57 
 
 		 548 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  28.75 
 
 		 558 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  30.77 
 
 		 555 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  27.56 
 
 		 543 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  30.98 
 
 		 552 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  29.96 
 
 		 549 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  31.51 
 
 		 536 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  31.17 
 
 		 537 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  29.46 
 
 		 538 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>