More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2971 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  98.88 
 
 		 356 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  54.15 
 
 		 235 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  49.12 
 
 		 231 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  47.56 
 
 		 244 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  50.67 
 
 		 232 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  46.12 
 
 		 239 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  45.18 
 
 		 240 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  42.34 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  39.74 
 
 		 232 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  42.31 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.01 
 
 		 106 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  59.79 
 
 		 111 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.29 
 
 		 102 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  56.31 
 
 		 109 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.64 
 
 		 111 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  55.67 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.25 
 
 		 105 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  55.56 
 
 		 108 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.42 
 
 		 119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  52.58 
 
 		 111 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  58.82 
 
 		 122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  54.17 
 
 		 111 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  54.9 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  53.4 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.04 
 
 		 105 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.76 
 
 		 106 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  56.7 
 
 		 109 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  51.04 
 
 		 111 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  51.04 
 
 		 111 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  51.04 
 
 		 111 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  50 
 
 		 111 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  51.04 
 
 		 111 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.21 
 
 		 128 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.21 
 
 		 128 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  48.96 
 
 		 111 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  52.08 
 
 		 105 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 		 110 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  54.55 
 
 		 111 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  49.47 
 
 		 98 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  30.92 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  29.36 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  28.89 
 
 		 533 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  31.37 
 
 		 540 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  27.17 
 
 		 550 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  30.33 
 
 		 536 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  27.55 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  27.41 
 
 		 563 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  28 
 
 		 530 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  26.95 
 
 		 541 aa  96.7  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  28.25 
 
 		 531 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  28.44 
 
 		 528 aa  95.9  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  28.24 
 
 		 565 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  30.12 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  26.95 
 
 		 542 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  27.73 
 
 		 543 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  30.2 
 
 		 533 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  28.44 
 
 		 535 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  26.95 
 
 		 542 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  30.4 
 
 		 532 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  26.95 
 
 		 542 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  27.38 
 
 		 543 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  27.56 
 
 		 530 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  29.72 
 
 		 535 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  27.38 
 
 		 543 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  31.03 
 
 		 549 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  26.95 
 
 		 542 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  29.18 
 
 		 549 aa  93.6  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  29.51 
 
 		 562 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  31.01 
 
 		 546 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  29.75 
 
 		 537 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  25.64 
 
 		 533 aa  92.8  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  29.32 
 
 		 535 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  26.67 
 
 		 543 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  24.9 
 
 		 539 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  62.16 
 
 		 74 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  26.98 
 
 		 543 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  28.69 
 
 		 568 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  26.88 
 
 		 545 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  27.73 
 
 		 543 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  25.98 
 
 		 539 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  34.67 
 
 		 526 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  31.03 
 
 		 545 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  31.17 
 
 		 527 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  30.18 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  52.48 
 
 		 108 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  30.47 
 
 		 597 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  31.74 
 
 		 587 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  29.3 
 
 		 543 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  27.73 
 
 		 543 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  30.43 
 
 		 560 aa  89.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>