84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0140 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 128 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 128 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  82.11 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  57.66 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.14 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.04 
 
 		 105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  56.48 
 
 		 105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  55.45 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.73 
 
 		 102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.26 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.48 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  57.66 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  51.82 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  49.53 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.6 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  53.27 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  47.66 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  52.34 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  51.92 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  49.04 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  52.25 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.94 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  48.57 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.85 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  49.02 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  54.29 
 
 		 356 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  54.29 
 
 		 356 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  49.07 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  49.06 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  41.74 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  38.78 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  33.67 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  34.69 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0502  hypothetical protein  60.47 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0663  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  60.47 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.27 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.31 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.86 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 461 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  29.41 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  29.29 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.43 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  29.47 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  35.16 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>