72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1128 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
105 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.05 
 
 
105 aa  184  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  75.96 
 
 
105 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  72.38 
 
 
105 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  69.9 
 
 
108 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.71 
 
 
106 aa  153  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.14 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.14 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  55.36 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.17 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  60.4 
 
 
111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  59.81 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.6 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  59.41 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  56.07 
 
 
120 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  54.13 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  56.25 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.88 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  56.25 
 
 
356 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  55.14 
 
 
137 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.96 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  51.89 
 
 
109 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  51.92 
 
 
111 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.63 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  52.75 
 
 
98 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  52.13 
 
 
111 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  52.13 
 
 
111 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  51.06 
 
 
111 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  49.47 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  45.87 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  50.68 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  41.3 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0663  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0502  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  34.04 
 
 
95 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
122 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
114 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
114 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  31.96 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.32 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.65 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>