60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8109 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
110 aa  227  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  57.14 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.28 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  53.85 
 
 
105 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  54.46 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  53.7 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.88 
 
 
105 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  54.46 
 
 
111 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  52.94 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  49.04 
 
 
111 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  50.48 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  49.52 
 
 
108 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  50.53 
 
 
356 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.85 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.85 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
106 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  49.47 
 
 
356 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  51.52 
 
 
109 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  47.66 
 
 
127 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.12 
 
 
119 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  49.5 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  38.78 
 
 
111 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  37 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  41.24 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  36.27 
 
 
111 aa  91.3  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  36.73 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  37.76 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  41.75 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  50.7 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0663  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.24 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0502  hypothetical protein  43.24 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  29.79 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  30.3 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  26.04 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  32.98 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
295 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  27.06 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  27.06 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.25 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  26.8 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  25.25 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>