72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02020 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  56.84 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.61 
 
 
102 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.61 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.58 
 
 
111 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  52.48 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  51.55 
 
 
111 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  52.58 
 
 
111 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.58 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.02 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.02 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  50.52 
 
 
111 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  50.52 
 
 
111 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.76 
 
 
105 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  50.52 
 
 
111 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  50.52 
 
 
111 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.75 
 
 
105 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  49.47 
 
 
108 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  50.52 
 
 
111 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  50.52 
 
 
111 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  52.22 
 
 
111 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  49.48 
 
 
111 aa  103  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  47.42 
 
 
122 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  49.47 
 
 
356 aa  100  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  49.47 
 
 
356 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  46.88 
 
 
109 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  48.45 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  48.94 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  52.05 
 
 
74 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.24 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  46.81 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  41.24 
 
 
116 aa  76.6  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  41.3 
 
 
97 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  39.36 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  35.05 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 
295 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  32.98 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  31.31 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  30.61 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  30.61 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  30.39 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.74 
 
 
134 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.74 
 
 
134 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  29.59 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.79 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  29.59 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  27.66 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  29.41 
 
 
84 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
106 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  25.25 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.24 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>