63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0683 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  65.26 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  47.87 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  39.8 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  34.04 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  30.93 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  30.93 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  30.93 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  32.98 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  30.85 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  34.41 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  34.41 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  29.9 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  33 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  32.65 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  32.97 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  31.18 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  32.29 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  30.93 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  30.93 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  32.26 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  30.61 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.82 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  29.59 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.85 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.25 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  31.03 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>