61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0521 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.52 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.52 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.65 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.65 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.59 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.36 
 
 		 106 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  88.16 
 
 		 84 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  53.54 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 		 115 aa  103  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.72 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.6 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.6 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  44.92 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  52.53 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  52.53 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.49 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 109 aa  95.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.37 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 461 aa  90.5  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.73 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.27 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  34.69 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0519  hypothetical protein  96.43 
 
 		 28 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  28.28 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  31.96 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  30.3 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  27.78 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.08 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  26.53 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  27 
 
 		 97 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  25.25 
 
 		 98 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  29.59 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  29.27 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>