60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3785 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  204  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  52.13 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  47.87 
 
 
96 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  44.57 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.16 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  41.94 
 
 
356 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  41.94 
 
 
356 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  42.27 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  38.04 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  38.78 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  40.22 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  41.3 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  37.11 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  31.91 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  30.85 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  39.51 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  30.53 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  29.79 
 
 
111 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  30.53 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  34.34 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  34.74 
 
 
111 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  34.41 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  34.74 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  40.85 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  34.41 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  31.58 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  27.72 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  27.72 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
118 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.74 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  30.3 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  27 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>