65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3323 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  82.46 
 
 
114 aa  200  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.49 
 
 
116 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.6 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  63.72 
 
 
118 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.28 
 
 
115 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.65 
 
 
114 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.95 
 
 
118 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.65 
 
 
114 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.61 
 
 
149 aa  146  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.87 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.29 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.41 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.02 
 
 
115 aa  136  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 
461 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  57.39 
 
 
120 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  57.39 
 
 
120 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.72 
 
 
129 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.41 
 
 
118 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  54.39 
 
 
114 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
109 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.77 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.77 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.66 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.66 
 
 
107 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  51.02 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 
224 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 
224 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.23 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  40.62 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  55.07 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.68 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  43.28 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.9 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  30.93 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  32.05 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  30.59 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  28.92 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  26.8 
 
 
105 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  31.88 
 
 
116 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  29.21 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  32 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  29.41 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  29.82 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  25.77 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  28.77 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>