71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5114 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  84.48 
 
 
118 aa  206  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.57 
 
 
114 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.57 
 
 
114 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.55 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.83 
 
 
116 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  68.14 
 
 
114 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.26 
 
 
115 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.7 
 
 
118 aa  163  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.37 
 
 
149 aa  159  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.03 
 
 
134 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.72 
 
 
115 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.14 
 
 
134 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.1 
 
 
129 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.06 
 
 
114 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.79 
 
 
116 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  67.54 
 
 
120 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  67.54 
 
 
120 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.95 
 
 
115 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  58.04 
 
 
461 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.96 
 
 
122 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.55 
 
 
109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.6 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.6 
 
 
109 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.26 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.33 
 
 
107 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  53.06 
 
 
101 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
107 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
107 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
107 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
107 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
107 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  50.51 
 
 
107 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 
224 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.49 
 
 
224 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.84 
 
 
192 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  48.39 
 
 
209 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 
224 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 
224 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  50.7 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.28 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  32.99 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  32.41 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 
109 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  31.31 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  28.16 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  37.88 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  30.93 
 
 
356 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  28.87 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  33.33 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  30.93 
 
 
356 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  28 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  30.21 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  25.77 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.43 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.43 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  28.87 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  24.24 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  27.84 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>