75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1664 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  65.26 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  52.13 
 
 
97 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  40.21 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  39.36 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  39.8 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  39.13 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  36.17 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.96 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  36.17 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  37.25 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  37.63 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  37.63 
 
 
356 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  31.63 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  37.36 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  37.63 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  36.56 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  32.99 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  32.99 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  29.9 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  29.9 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  29.9 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  29.9 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  35.05 
 
 
109 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  28.72 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  44.68 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  32.99 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  29.59 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  31.31 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  30.3 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.82 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
107 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  36.78 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
461 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
295 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>