84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1303 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  53.54 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.04 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.04 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  54.08 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  54.08 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  52.04 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.04 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.5 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.04 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  51.04 
 
 		 461 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.98 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.98 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.8 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  57.58 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 		 224 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.11 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  34 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  36.08 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  36.08 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  35.05 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  35.05 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  32.32 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  31.25 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  32.99 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  29.9 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  31.71 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  31.25 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  32.32 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  33.78 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  35.8 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  29.81 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  34.34 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  31.63 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  35.05 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  32.65 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4720  hypothetical protein  48.72 
 
 		 44 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>