72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3574 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.39 
 
 
134 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.57 
 
 
134 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.37 
 
 
118 aa  159  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.27 
 
 
114 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.27 
 
 
114 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.96 
 
 
116 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  67.57 
 
 
118 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.74 
 
 
129 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.5 
 
 
116 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.27 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.18 
 
 
115 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.93 
 
 
114 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  67.57 
 
 
120 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  67.57 
 
 
120 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.61 
 
 
115 aa  146  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  62.16 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.16 
 
 
118 aa  143  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 
115 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  54.13 
 
 
461 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.38 
 
 
122 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.72 
 
 
128 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.94 
 
 
109 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.94 
 
 
109 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.48 
 
 
107 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  47.96 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 
224 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.34 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.34 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.34 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.34 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.34 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  45.37 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 
224 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.45 
 
 
192 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 
224 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  42.86 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  40.91 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  30.1 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  34.15 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  29.9 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  33.7 
 
 
109 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.74 
 
 
105 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  28.26 
 
 
137 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  34.43 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  35.42 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.18 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  29.67 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  27.71 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  28.09 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  29.41 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4720  hypothetical protein  48.72 
 
 
44 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  28.09 
 
 
356 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>