52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0520 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  176  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  97.37 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  97.37 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  88.16 
 
 		 107 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.44 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.44 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.44 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.44 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.44 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  76.06 
 
 		 106 aa  120  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  57.58 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.06 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.19 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.07 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.88 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.93 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.67 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  52.11 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.38 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  56.06 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.7 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  56.06 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.28 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  48.48 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.33 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.77 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.48 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  46.38 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.89 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.89 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.28 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 		 224 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  35.94 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.73 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  30.43 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  29.41 
 
 		 98 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 128 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 128 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>