55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2237 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.25 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.25 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.25 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.25 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.25 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  77.36 
 
 		 107 aa  176  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.39 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.39 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  76.06 
 
 		 84 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  49.5 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.02 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  49.06 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  49.06 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.98 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.23 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 		 461 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.28 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  43.4 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  44.34 
 
 		 114 aa  84.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.43 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.43 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.41 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.14 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.38 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0519  hypothetical protein  85.71 
 
 		 28 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  28.28 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  26 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 105 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  25.51 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  26.8 
 
 		 98 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.74 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  27.17 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  28.87 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>