70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3716 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
122 aa  257  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.96 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.29 
 
 
114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.29 
 
 
114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.38 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.46 
 
 
114 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  48.62 
 
 
118 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.38 
 
 
149 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  50.44 
 
 
120 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.38 
 
 
115 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  50.44 
 
 
120 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  48.15 
 
 
461 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
116 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
116 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.54 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  45.45 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.71 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.64 
 
 
116 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.17 
 
 
109 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.23 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.23 
 
 
109 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.26 
 
 
128 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.76 
 
 
107 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  39.8 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.37 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.77 
 
 
224 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  34.41 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  34.34 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  43.28 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  29.9 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  29.17 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  36 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  30.93 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  26.92 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  25.84 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
105 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  25.77 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  26.8 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  25 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  27.55 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  27.91 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  29.27 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  25.3 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.74 
 
 
109 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.1 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4720  hypothetical protein  41.03 
 
 
44 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.99 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>