83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1569 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  60.95 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  60.95 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.73 
 
 
115 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.33 
 
 
118 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  51.43 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.33 
 
 
114 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.33 
 
 
114 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 
118 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.4 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  47.62 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 
134 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.48 
 
 
149 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.43 
 
 
129 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.33 
 
 
116 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.62 
 
 
109 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.62 
 
 
109 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.48 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 
116 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 
128 aa  105  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.71 
 
 
109 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.52 
 
 
114 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.76 
 
 
122 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.66 
 
 
115 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  50.51 
 
 
101 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  46.6 
 
 
461 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  44.44 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
224 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
224 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  36.56 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  48.48 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4720  hypothetical protein  66.67 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  31.68 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  32.63 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  34.57 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  30.53 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  29.47 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  33.85 
 
 
74 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  30.59 
 
 
116 aa  52  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  29.47 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  31.25 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  29.47 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  29.59 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  28.42 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  30.3 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  29.81 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  28.87 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0683  hypothetical protein  28.87 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3785  hypothetical protein  28.28 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153969  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  26.47 
 
 
122 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  27.08 
 
 
356 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  27.08 
 
 
356 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  26.04 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0010  hypothetical protein  29.76 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.24 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  32.89 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  35.42 
 
 
108 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>