44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4236 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.85 
 
 
112 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  49.5 
 
 
115 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  46.36 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  47.47 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  41.12 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  34.44 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  32.63 
 
 
356 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  41.54 
 
 
356 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  30.85 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
102 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  30.85 
 
 
111 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  31.52 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1128  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.09622  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  28.72 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  31.94 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  30.34 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1779  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1728  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1605  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  31.33 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1557  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3458  hypothetical protein  30.88 
 
 
109 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  27.38 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  30.12 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>