30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3457 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  92.59 
 
 
108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  92.59 
 
 
108 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  94.29 
 
 
108 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  64.42 
 
 
115 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  45.45 
 
 
110 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  47.37 
 
 
120 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
112 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  34.44 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  36.79 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  36.79 
 
 
356 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
119 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  36.14 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  40.58 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  29.59 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  25.53 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  26.6 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3598  jemb  25.53 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
105 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  25.53 
 
 
111 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>