More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1479 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1479  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 619 aa  1223    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2475  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  96.75 
 
 		 621 aa  1075    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  98.85 
 
 		 609 aa  1190    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1393  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.78 
 
 		 580 aa  831    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0045  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.04 
 
 		 556 aa  359  9e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6433  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 		 621 aa  356  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6432  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.72 
 
 		 619 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0046  Zn-dependent protease-like protein  25.04 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 		 460 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.57 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.06 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  31.85 
 
 		 460 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.32 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.73 
 
 		 443 aa  101  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  30.74 
 
 		 445 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.02 
 
 		 437 aa  98.2  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.88 
 
 		 446 aa  97.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  30.4 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.11 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 476 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 		 475 aa  94.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 		 444 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 483 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 462 aa  90.9  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.61 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  29.6 
 
 		 467 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.33 
 
 		 470 aa  88.2  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.64 
 
 		 474 aa  87.4  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.42 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 458 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  27.45 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  31.54 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.82 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  29.6 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.47 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.23 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.5 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.83 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.7 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.19 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.51 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 458 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.6 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.81 
 
 		 458 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.92 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  28.92 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  25.96 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.81 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  30.43 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  26.77 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  28.08 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  29.82 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.52 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.93 
 
 		 475 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  28.14 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  28.08 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  29.45 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.69 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  26.64 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.37 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.45 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.62 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  26.19 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.78 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  28.52 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  28.81 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  26.19 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  26.19 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  26.19 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  26.19 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  29.59 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  27.49 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.27 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>