283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0045 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0045  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
556 aa  1131    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6433  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 
621 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.25 
 
 
609 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1479  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.43 
 
 
619 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1393  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.25 
 
 
580 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088889  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2475  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.06 
 
 
621 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0046  Zn-dependent protease-like protein  27.71 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6432  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.4 
 
 
619 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.76 
 
 
483 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  30.95 
 
 
460 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 
464 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  30.5 
 
 
460 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 
460 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.57 
 
 
464 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 
476 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.71 
 
 
497 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.98 
 
 
437 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
460 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.67 
 
 
460 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 
443 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.45 
 
 
475 aa  93.6  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.37 
 
 
470 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
469 aa  92  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.88 
 
 
464 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  29.5 
 
 
445 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.52 
 
 
462 aa  88.6  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.69 
 
 
444 aa  87.4  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.69 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.8 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
489 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 
474 aa  84  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
482 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.25 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  27.31 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  27.34 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 
482 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.41 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  28.41 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  28.41 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  28.41 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  25.16 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  28.06 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 
456 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.49 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.46 
 
 
458 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  26.78 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.37 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.91 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.65 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  28.06 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.87 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.43 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  29.5 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  29.43 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  26.72 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  26.72 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  27.03 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  26.72 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  26.72 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  26.72 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  28.24 
 
 
485 aa  77  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.24 
 
 
485 aa  77  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 
473 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
458 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.45 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  26.62 
 
 
480 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 
473 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.3 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  27.8 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 
454 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.35 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.84 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  26.39 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  28.03 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  27.94 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  27.97 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  27.2 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  28.09 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.1 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>